定量线粒体蛋白组学样品制备
定量线粒体蛋白组学样品制备的主要步骤如下:
1.细胞或组织收集
从细胞培养或组织中获取样品。
2.线粒体分离
裂解细胞或组织以释放线粒体。
使用差速离心法分离线粒体。
3.蛋白提取
使用合适的缓冲液(如RIPA缓冲液)裂解线粒体,提取蛋白质。
离心去除不溶性碎片,收集上清液。
4.蛋白定量
使用BCA法或Bradford法定量蛋白浓度。
5.蛋白质消化
使用胰蛋白酶等酶切蛋白质,获得肽段。
6.肽段标记(可选)
使用iTRAQ、TMT等同位素标记肽段进行定量分析。
7.液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)
将肽段上样至液相色谱系统分离。
通过质谱仪分析肽段,获取质谱数据。
8.数据分析
使用专用软件(如MaxQuant、Proteome Discoverer)进行定量和鉴定分析。
9.结果验证(可选)
使用Western blot、ELISA等方法验证关键蛋白质的表达变化。
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