泛素化蛋白用什么富集
常用的泛素化蛋白富集方法主要包括:
1、抗泛素抗体富集:
这是最常见的泛素化蛋白富集方法之一。研究人员使用具有高亲和力的抗泛素抗体,将其结合到泛素化蛋白上,然后通过免疫沉淀或亲和层析等方法将泛素化蛋白与抗体结合,随后可以用于进一步的分析,如质谱鉴定或蛋白质亲和实验。这些抗体可以特异性地识别并结合到蛋白质上的泛素标签。常用的是抗K48和K63链特异性的泛素抗体,以及能识别多种泛素链类型的泛素抗体。
2、泛素结合域的使用:
泛素结合域(如TUBEs、UBA、UBD等)可以特异性地结合泛素链。通过融合这些结合域到固相基质(如琼脂糖珠),可以用来富集泛素化蛋白。
(1)Tandem Ubiquitin Binding Entities (TUBEs):TUBEs是一种用于富集泛素化蛋白的亲和纯化工具。它们是一种具有高亲和力的蛋白质结构域,可以选择性地结合泛素链,从而允许泛素化蛋白的富集和分离。
(2)Ubiquitin Affinity Resins:一些商业化的亲和树脂或柱子被功能化为具有高亲和力的泛素结构域,可以用于富集泛素化蛋白。研究人员可以将样品通过这些树脂或柱子,以捕获和富集泛素化蛋白。
(3)Ubiquitin Binding Proteins:一些蛋白质分子,如UBD(Ubiquitin-binding domains)家族的成员,具有高亲和力的泛素结合结构域,可以用于富集泛素化蛋白。研究人员可以将这些泛素结合蛋白与样品混合,然后通过亲和纯化将泛素化蛋白富集出来。
3、免疫沉淀:
使用抗泛素抗体进行免疫沉淀也是一种常用的方法,可以从复杂的样品中分离泛素化蛋白。
图1. 泛素化修饰研究路线
实验操作中,需要注意样品的处理和储存条件,以防止蛋白降解或泛素标签的丢失。同时,使用质谱等技术可以进一步鉴定和分析富集得到的泛素化蛋白。
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