圆二色谱测定蛋白质
- 选择一个合适的缓冲液,确保它在CD谱的测量范围内不产生明显的背景信号。
- 蛋白质的浓度通常在0.1到1 mg/mL之间,但最佳浓度取决于蛋白质的性质和CD光谱仪的灵敏度。
- 在没有蛋白质的情况下测量所选缓冲液的CD信号,以得到背景光谱。
- 在约190-250 nm的范围内测量蛋白质样品的CD信号。
- 从蛋白质样品的CD信号中减去背景光谱。
- 将得到的差值光谱转换为平均残基椭圆度 (MRE),这是一个与蛋白质浓度和路径长度有关的单位。
- 根据光谱的特征波长和形状,估算蛋白质的二级结构内容。
- 使用专门的软件(如SELCON3、CONTIN或CDPro)可以更精确地计算α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和其他二级结构的比例。
圆二色光谱(CD,Circular Dichroism)基于光学异构体对平面偏振光的旋光异构性进行光谱测量。当平面偏振光通过一个光学活性的物质时,它的两个正交的振荡分量被不同地吸收,从而产生了一个椭圆偏振光。
CD光谱能够提供有关蛋白质、多肽和其他光学活性分子的结构和构象变化的信息。蛋白质的α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲等二级结构元素具有特定的CD信号。通过分析CD光谱,可以估计蛋白质的二级结构成分。
图1. 蛋白质结构鉴定
使用圆二色谱测定蛋白质的基本步骤如下:
1、样品准备:
2、背景测量:
3、样品测量:
4、数据处理:
5、数据解释:
CD测定的优点是快速、不破坏样品,可以用于实时监测蛋白质的构象变化。但需要注意的是,CD谱只能提供蛋白质二级结构的大致信息,而不能给出详细的三维结构信息。
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