蛋白标记定量
蛋白标记定量（Protein Labeling Quantification）是一种用于分析蛋白质表达和调控的实验技术，蛋白质在实验中会与特定的标记分子结合，旨在量化分析特定蛋白质或多个蛋白质在不同样品中的表达水平。
蛋白标记定量的关键步骤通常包括：
1、蛋白质提取：
首先从研究的生物样本（如细胞、组织或体液）中提取蛋白质。
2、蛋白质标记：
将蛋白质与化学标签或同位素标签结合。这些标签可以是稳定同位素标记（如SILAC）、同位素标记的氨基酸（如iTRAQ）或其他特定的化学标记物。这些标记允许研究人员在后续分析中区分和量化不同样本中的相同蛋白质。
图1. 使用SILAC进行蛋白质定量（Esthelle et al.,2019）
3、蛋白质分离与鉴定：
通过液相色谱（LC）、二维凝胶电泳（2D-PAGE）等技术将蛋白质分离。之后，通常使用质谱（MS）技术对标记的蛋白质进行鉴定和定量。
4、数据分析：
利用生物信息学工具对获得的数据进行分析，比较不同样本或处理条件下的蛋白质表达差异。
| SILAC定量 | Dimethyl定量 |
|---|---|
| 活细胞标记 | 标记裂解后的细胞和组织 |
| 代谢标记，培养基加入同位素标记的氨基酸和精氨酸对蛋白进行标记 | 化学标记，通过与肽段N端或者赖氨酸残基进行反应对多肽进行标记 |
| 标记不受翻译后修饰影响 | 被修饰的非赖氨酸N端肽段无法被标记，因此不能被定量检测 |
| 可以通过 pulse & trace 实验研究蛋白合成代谢 | 标记成本低 |
| 样品混合在实验初期进行 | 样品混合在蛋白酶切以后进行 |
图2. SIALC与Dimethyl标记法对比
蛋白标记定量服务在生物医学研究、药物开发、疾病诊断等领域有广泛的应用，特别是在研究蛋白质如何在不同条件下表达和调控方面。通过定量分析蛋白质的表达，研究人员可以更好地了解疾病的机理，发现潜在的生物标记物，或评估药物的效果。
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