代谢组学分析后筛选到了差异代谢物,但是不在已知化合物库里,该怎么得到该化合物结构和更多信息呢?
当代谢组学分析中筛选到的差异代谢物不在已知的化合物库里时,这意味着你可能遇到了一个新的或尚未被广泛记录的代谢物。为了获取该化合物的结构和更多信息,可以采取以下策略:
1.深入的MS/MS分析:
(1)如果可能的话,进行二级或多级质谱(MS/MS)分析,以获得代谢物的碎片信息。
(2)利用得到的碎片图谱推断可能的化合物结构。
2.核磁共振(NMR)分析:
(1)NMR是一种强大的结构鉴定工具,可以提供有关化合物结构的详细信息。
(2)对于未知的代谢物,你可能需要从样品中分离和纯化出足够的量,然后进行NMR分析。
3.合成参考物:
(1)根据MS和NMR的数据,尝试合成可能的结构作为参考物。
(2)合成的参考物可以进行进一步的质谱和NMR分析,与未知代谢物进行对比。
4.与其他数据库对比:
(1)尽管该代谢物不在你目前使用的数据库中,但它可能存在于其他较小或专门的数据库中。
(2)考虑查看不同的化合物和代谢物数据库,或者扩展到其他生物信息学资源。
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