杂交瘤测序

    杂交瘤测序是对通过杂交瘤技术产生的细胞进行基因测序的过程,用于研究杂交瘤细胞的基因组信息。杂交瘤细胞是在实验室中通过细胞融合技术,将具备特定抗体产生能力的B细胞与不朽化的骨髓瘤细胞融合而成的细胞。通过这种方法,研究人员能够创建出既具有抗体分泌能力,又可以无限增殖的细胞系。杂交瘤技术用于制备单克隆抗体,将能产生抗体的 B 淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合,形成的杂交瘤细胞既具有 B 淋巴细胞产生特异性抗体的能力,又具有骨髓瘤细胞在体外无限增殖的特性。杂交瘤测序就是为了深入分析这些细胞的基因组,为科学家们提供更加详尽的遗传信息。在单克隆抗体药物的研发中,杂交瘤测序是必不可少的环节。通过测序确定的抗体序列可以用于优化抗体的亲和力、稳定性和药效等性能,从而开发出更有效的治疗药物。例如在癌症治疗中使用的单克隆抗体药物,通过杂交瘤测序不断改进抗体的靶向性和治疗效果。杂交瘤测序的作用不可低估。杂交瘤测序可以帮助研究人员了解杂交瘤细胞的基因组结构,揭示影响抗体产生的基因调控机制,并寻找可能导致杂交瘤不稳定的遗传因素。此外,通过杂交瘤测序,科学家可以识别出抗体基因的独特序列特征,为优化抗体生产提供指导。

     

    一、测序流程

    1、DNA 提取

    从杂交瘤细胞中提取基因组 DNA 或者 mRNA。如果提取 mRNA,还需要通过逆转录酶将其反转录为 cDNA。mRNA 提取的优势在于可以直接获取编码抗体的基因信息,因为它去除了内含子等非编码序列,更方便后续的测序分析。

     

    2、引物设计

    根据抗体基因的已知序列特征设计引物。对于抗体的重链和轻链可变区,通常有保守的序列框架可以作为引物设计的靶点。引物的质量直接影响测序的准确性和完整性。

     

    3、PCR 扩增

    使用设计好的引物对目标抗体基因片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。这一步可以增加目标基因片段的数量,使其达到可以进行测序分析的量。PCR 过程中需要严格控制反应条件,如温度、时间和酶的活性等,以确保扩增的特异性和效率。

     

    4、测序技术选择

    (1)Sanger 测序:具有测序长度长、准确性高的优点,适合对单个或少数几个杂交瘤细胞产生的抗体基因进行测序。但是其通量较低,对于大规模的测序项目效率不高。

    (2)二代测序(NGS):如 Illumina 测序技术,可以同时对多个样本或者大量的 DNA 片段进行测序,能够高通量地获取杂交瘤细胞的抗体基因序列信息。不过其测序读长相对较短,在数据分析时可能需要更多的拼接等处理步骤。

     

    5、数据分析

    对测序得到的数据进行分析,包括序列拼接、比对和注释等。通过与已知的抗体基因数据库进行比对,可以确定所测抗体基因的类型、家族以及其独特的可变区序列特征。还可以分析序列的突变情况、潜在的糖基化位点等影响抗体功能的因素。

     

    二、杂交瘤测序的目的

    1、抗体基因鉴定

    确定所产生抗体的基因序列。通过测序,可以明确抗体的重链和轻链的可变区序列,这些区域决定了抗体的抗原结合特异性。

     

    2、质量控制

    在单克隆抗体的研发和生产过程中,对杂交瘤细胞进行测序可以保证抗体的一致性和稳定性。比如在不同批次的抗体生产中,通过比对测序结果,确保产生的抗体在基因水平上没有发生变化。

     

    3、新抗体发现

    通过对杂交瘤细胞的测序,有可能发现具有新的抗原结合特性的抗体,为药物研发、疾病诊断等领域提供新的工具。

     

    杂交瘤测序的一大优势是其高灵敏度和高分辨率。相比于传统的基因分析方法,杂交瘤测序能够精确定位基因组中的突变位点,识别复杂的基因重排和拷贝数变异。百泰派克生物科技一直专注于杂交瘤测序分析服务,我们拥有经验丰富的科研团队,能够为客户提供从样品制备、杂交瘤测序分析到数据处理的一站式服务。我们提供的杂交瘤测序服务,依托先进的测序平台和精湛的生物信息分析能力,能够为客户提供全面精准的基因组解析。如您对杂交瘤测序有任何需求或疑问,欢迎随时与我们联系,我们的专家团队将竭诚为您服务。

     

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