LC-MS/MS蛋白质组学分析

    基于液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组学可以揭示定量蛋白质组的状态,从而提供深入了解相关细胞或组织生物化学状态的机会。蛋白质并不是孤立的分子而是具有三维结构的物质,并且协同其他蛋白质分子一起参与调控各种生命活动,它们的空间结构和模块构成与其表达水平同样重要。基于LC-MS/MS的蛋白质组学方法结合生物化学手段,对于研究蛋白质组的结构单位有很大帮助作用。

     

    目前,随着高校液相色谱(HPLC)分离技术与质谱(MS)鉴定技术的升级与发展,液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)已然成为蛋白质组学分析的主流技术。在LC-MS/MS蛋白质组学分析中,蛋白质可以从各种生物体中提取包括细菌、细胞、组织和体液,并酶解成多肽后进行LC-MS/MS检测。LC-MS/MS采用串联质谱,既能得到分子离子峰,又有碎片离子峰,因而可以用来对蛋白质进行定性和定量分析。串联质谱可以用不同的方式采集数据,最为广泛的是非靶向方法(如鸟枪法或DDA),虽然此法相对简单且可以应用于任意的样本,而无需事先对样本进行任何了解,但是获得的数据可能会因有一定随机性而丢失部分信息。相比之下,高度一致的方式采集靶向肽段碎片离子信息,虽会提高准确度和灵敏度,但被限制于一个相对较小范围内。此外,蛋白质组学的研究取决于实验技术策略、质谱的高分辨率和高灵敏度以及定量算法和软件更新;这些方法和技术为定量蛋白质组学提供了研究手段和技术保障。

     

    百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,能够对各种样品中的蛋白质进行蛋白质质谱鉴定服务。您只需要将您的需求和样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括样品前处理、质谱分析、质谱原始数据分析和生物信息学分析。

     

    相关服务:

    多肽质谱鉴定

    Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定 

    膜蛋白鉴定服务 

    Pull-down靶蛋白质谱鉴定 

    蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定 

    蛋白鉴定

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