iTRAQ标记技术工作机制及其优势
- 样本质量评估与标准化处理
- 同位素标签标记优化与质控
- 基于Orbitrap高分辨质谱平台的数据采集
- 差异蛋白筛选、GO/KEGG功能富集、PPI网络分析等生信支持
在蛋白质组学的研究中,多样本高通量定量分析一直是科研人员关注的重点。随着质谱技术的发展,iTRAQ标记技术因其灵敏、准确、可多通道并行处理样本的特点,被广泛应用于疾病机制研究、药物作用机制探索和生物标志物筛选等领域。
一、iTRAQ标记技术工作机制
1、原理
iTRAQ 是基于同位素标记的蛋白质组学定量技术,其定量核心在于:对不同样本来源的肽段进行等质量的化学标记,在质谱二级碎裂(MS/MS)中释放出特异的“报告离子”,从而实现多个样本的相对定量。
2、工作流程
(1)蛋白提取与酶解:将多个样本中的蛋白提取后,统一用胰蛋白酶酶解为肽段。
(2)iTRAQ试剂标记:每个样本分别用不同编号的iTRAQ试剂进行化学标记(如114, 115, 116...最多可达8或10通道)。
(3)样本混合:标记后的肽段混合为一个样本,进入同一次质谱分析。
(4)LC-MS/MS 分析:在MS1阶段,各肽段因等质量标签而不可区分,在MS/MS阶段,标签释放出特定质量的报告离子(Reporter ions),通过其强度反映样本中肽段的相对丰度。
(5)数据分析与定量:通过报告离子强度比值,进行不同样本间蛋白表达差异的比较。
二、iTRAQ标记技术的核心优势
1、多通道并行定量,提升效率
iTRAQ最大亮点之一是可实现8通道(甚至10通道)样本的同步定量分析。相比单样本处理方法,iTRAQ极大提升了实验效率,并减少了不同批次操作带来的系统偏差。
2、同步分析,减少实验偏差
由于所有样本在标记后被统一混合、共同处理与分析,iTRAQ技术在实验流程上高度统一,能有效减少样本间的处理差异,提高数据的可比性与一致性。
3、灵敏度高,适合复杂样本
iTRAQ标记结合高分辨率质谱(如Orbitrap、QTOF)可检测并定量低丰度蛋白、膜蛋白和组织特异性蛋白,广泛适用于复杂样本类型,如血浆、脑组织、肿瘤组织等。百泰派克生物科技通过纳升流LC-MS/MS系统和深度优化的前处理流程,实现高覆盖度的蛋白组数据获取,助力科研人员发现关键调控因子。
4、适配生物信息学多维分析
iTRAQ标记技术生成的数据具备良好的归一化基础,便于与多组学(如代谢组、转录组)进行整合分析,助力系统生物学研究与网络通路挖掘。
百泰派克生物科技:助力高质量iTRAQ实验方案设计与执行
虽然iTRAQ技术在定量蛋白组学中表现优异,但其对实验操作精度、质谱平台和数据分析能力要求较高。百泰派克生物科技提供一站式iTRAQ定量服务,涵盖:
我们结合多组学整合能力,可提供iTRAQ+代谢组学联合分析、iTRAQ+磷酸化修饰研究等个性化科研解决方案。
尽管近年来TMT等新一代标签技术逐渐兴起,iTRAQ标记技术依旧以其成熟、稳定和多通道并行的特性,在特定科研场景中占据一席之地。百泰派克生物科技将以专业的技术支持和灵活的服务方案,助力您的科研项目快速推进、成果发表。联系我们,共建高效蛋白组学研究平台。
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