DIA定量蛋白质组实验步骤
DIA(Data independent acquisition)是基于静电场轨道阱Orbitrap质谱的一项全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术。DIA定量蛋白质组学分析即采用DIA数据采集模式对特定质量区间内的所有肽段母离子进行二级质谱检测,并结合高质量肽谱图库对扫描的所有母离子的碎片信息进行蛋白质组学分析。
采用DIA进行蛋白质分析无需指定目标肽段,且其扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选,并可实现数据回溯。因此,DIA技术更适合于大样本量、复杂体系的蛋白检测。
DIA定量蛋白组技术大致流程为:样品蛋白抽提与纯化、目标蛋白酶解、肽段分离、质谱检测以及数据分析。需对样品进行传统的较高深度的DDA数据采集,构建一个尽可能齐全的高质量肽段的谱图库(Spectral Library)。然后根据谱图库进行DIA数据采集,数据采集时需要确定一个合理的保留时间窗口,以避免选择错误的色谱峰,采集过程中对窗口内的所有肽段都进行二级碎裂,并采集相应高分辨率的二级谱图。
百泰派克生物科技采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统提供DIA定量蛋白质组学分析服务,其具有快速扫描速度和串联四极杆质谱系统的定量灵敏度能力,集质谱系统的高分辨、准确质量数稳定性、高灵敏度和高速度扫描特点于一身。您只需要将样品寄出,我们将负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。
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