蛋白质谱对样品的要求

    质谱技术是蛋白质组学研究中的重要技术,可以实现多种蛋白质分析。进行蛋白质质谱分析首先要制备合适的样品,样品的好坏程度与实验结果的准确度息息相关,很多小伙伴在问蛋白质质谱样品怎么准备、需要多少量等,这次小编就从样本类型、样本含量以及其他注意事项三个方面给大家介绍一下蛋白质质谱分析中样品制备相关的内容。

    一、蛋白样本类型:

    可以用于质谱分析的蛋白样本类型很多,包括动植物/微生物细胞或细胞裂解液、动植物组织、体液样品如血清/血浆/尿液等、蛋白胶条/胶点以及Pull down/Co-IP/IP蛋白样本等。

    二、不同的蛋白质样本的含量需求如下表所示:

    样本
    类型
    蛋白溶液细胞动物常规组织植物常规组织细菌与真菌菌体胶点胶条、Pull down/Co-IP/IP蛋白样本
    用量50ug
    (2ug/ul)
    1*107/(50ul细胞沉淀)100mg0.1-2g100mg/100ul胶条大小以1cm*1cm大小为宜,蛋白含量不低于20ug

    三、其他注意事项:

    1、对于蛋白质溶液样本需提供溶剂的试剂成分;

    2、若样品中含有毒性或腐蚀性的物质,必须事先声明;

    3、一些病原性的微生物或具有侵染性的病变组织需进行灭活;

    4、用银染法进行蛋白胶染色时,应选择与质谱分析兼容的试剂,银染的样本不能进行脱色。

    综上可知,制备蛋白质质谱样品没有一个固定或统一的方法,应根据具体的实验目的和质谱分析的要求进行样本制备,在样本制备过程中应遵循准确记录、迅速低温的原则,最大限度的缩短样本采集到实验的时间,避免蛋白质发生降解。

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