蛋白组学PRM和DDA

PRM（Parallel Reaction Monitoring）平行反应监测和DDA（Data Dependent Acquisition）数据依赖采集模式是两种不同的质谱扫描模式或称数据采集模式。二者的区别如下表所示：

	PRM	DDA
原理	利用高分辨、高精度的四级杆质量分析器选择目标肽段的母离子进行二级质谱，对每一个母离子产生的所有碎片离子进行全扫描	根据预设的条件如信噪比、同位素分布和离子强度等筛选肽段母离子进行二级质谱片段化和分析
优点	无需建立子离子对选择条件，分析方法简单，省时省力，质量精度高、灵敏度高、准确性好	采用较窄的质荷比（通常为~1Da）窗口筛选目标离子，减少了干扰离子的存在，可以提供较高质量的碎片信息
缺点	实验前需要明确目标蛋白或肽段，设计和建立针对这些目标蛋白/肽段的PRM质谱采集方法	目标离子的筛选是一个随机的过程，强度较高的离子更容易被选择成为目标离子进行二级质谱信息获取，导致重复性较差，覆盖率较低
应用	主要用于靶向蛋白质组学的研究	主要用于非靶向蛋白质组学的研究

百泰派克生物科技采用AB SCIEX TripleTOF 5600结合Nano-LC色谱，提供基于PRM和DDA数据采集模式的蛋白质质谱分析服务技术包裹，可对各种蛋白进行快速精确的定性和定量鉴定，还可分析蛋白质相互作用，表征蛋白质翻译后修饰方式等，欢迎免费咨询。

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