蛋白组学肽质量指纹谱

蛋白质的鉴定方法主要是利用蛋白质的各种属性参数如相对分子质量、等电点、氨基酸组成和序列、肽质量指纹图谱等在蛋白质数据库中进行检索，寻找与这些参数相符的蛋白质。肽质量指纹图谱（Peptide mass fingerprint，PMF）是指利用质谱检测获得的肽片段质量进行蛋白质鉴定的技术，被认为是鉴定蛋白质最快速、最有效的方法。其基本原理是利用质谱仪检测到的蛋白质各种肽片段的质荷比运行检索软件，在蛋白质理论数据库中进行检索，寻找具有相同肽质量指纹的蛋白质，以达到鉴定蛋白质的目的。肽质量指纹图谱鉴定蛋白质的精确性依赖于蛋白质数据库中数据的准确性、比对算法以及其检索软件的功能。目前，已开发建立了许多基于PMF的数据库分析软件，如MS-fit、Peptident、MOWSE、ProfFound和PeptideSearch等。

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