我应该如何储存我的单细胞悬浮液以备scRNA-seq?
一般来说,新鲜制备的样品将提供最佳数据,其次是冷冻保存。冷冻保存在解冻过程中会导致失去一些细胞,但转录组是可比较的(特定于样品)。我们不支持在单细胞基因表达或单细胞免疫分析中使用其他固定类型,例如破坏膜稳定性的甲醛,这是保持分析的“单细胞性”所必需的。此外,核酸的交联和降解可能会影响数据质量。即使在批量RNA Seq中,从甲醛固定的样品中获得降解的RNA也是常见的,因此在10x单细胞RNA Seq分析中不建议使用甲醛固定。
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