ScATAC测序需要多少reads?
所需的reads数量取决于基因组大小、已知基因的数量、细胞类型和样本的染色质状态。对于大多数研究,50,000个read对是scATAC-Seq的最小读取深度(25,000个read1;25,000个reads2)。我们建议每个细胞总共读取75,000次,以最大限度地识别每个细胞中的开放染色质区域。
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所需的reads数量取决于基因组大小、已知基因的数量、细胞类型和样本的染色质状态。对于大多数研究,50,000个read对是scATAC-Seq的最小读取深度(25,000个read1;25,000个reads2)。我们建议每个细胞总共读取75,000次,以最大限度地识别每个细胞中的开放染色质区域。
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