ScATAC测序分析使用何种平台和读取长度?
ScATAC-Seq通常在10x Genomics Chromium系统结合Illumina NGS测序平台完成,Chromium系统使用微流控芯片将细胞分隔到数以万计的 Gel Beads-In-Emulsion (GEM) 中,这种组合使研究人员能够以高通量方式从生物信息学上识别数百到数千个单细胞的reads。10X scATAC文库使用双末端测序和双索引配置,read1:50个循环,i7索引:8个循环,i5索引:16个循环,read2:50个循环。
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