死细胞如何影响ScATAC测序数据?

    细胞活力低会导致Chromium控制器中的细胞恢复不可靠,进而导致测序目标缺失和结果欠佳。此外,死亡或凋亡细胞释放的环境DNA片段会增加背景噪音,从而影响数据质量。为了最大限度地提高单细胞项目中有用的测序数据量,必须尽量减少死细胞的存在。我们建议细胞活力超过90%,最低为70%。存活率低于70%的样品可能会进行死细胞去除 (DCR)。DCR至少需要106个细胞,并且之前无需使用磁珠进行处理。


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