ATAC-Seq的步骤?

    ATAC测序大致分为两个部分,即细胞制备和转座。细胞制备:第一步需要收获细胞。由于用于ATAC-Seq分析的细胞数量对于转座反应和生成的DNA片段的大小分布至关重要,因此对细胞进行计数非常重要。此外,细胞应完好无损,并且是均匀的单细胞悬浮液。收获后,用非离子型去污剂裂解细胞以产生纯细胞核。转座反应:将所得的染色质片段化,并同时使用Tn5转座酶进行测序接头标记,以生成ATAC-Seq文库。纯化后,可使用barcode引物通过PCR扩增文库。所得文库再通过qPCR或NGS进行分析。


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