ATAC-seq数据的预期重复率是多少？

重复读长通常是文库制备过程中PCR重复的结果，在预处理步骤中，这些读长被标记并删除。 由于Tn5 酶的插入是随机的，因此PCR重复代表伪影，可能会影响下游分析。低重复率 (< 5-10%) 是最佳选择，虽然稍高的重复率仍然可以接受 (< 20-30%)，但较高的百分比可能表明样品制备步骤存在问题。



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