ATAC-seq数据的预期重复率是多少?

    重复读长通常是文库制备过程中PCR重复的结果,在预处理步骤中,这些读长被标记并删除。 由于Tn5 酶的插入是随机的,因此PCR重复代表伪影,可能会影响下游分析。低重复率 (< 5-10%) 是最佳选择,虽然稍高的重复率仍然可以接受 (< 20-30%),但较高的百分比可能表明样品制备步骤存在问题。


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