覆盖度和读取深度有什么区别?ATAC测序数据需要多少reads?

    覆盖率和读取深度是衡量文库测序情况的指标。从视觉上看,覆盖率是从水平方向来说的,而读取深度是从垂直方向来说的。覆盖率或覆盖宽度回答了“测序覆盖了多少样本?”。它可以表示为测序读数覆盖的碱基百分比,例如95%的覆盖率表明样本中95%的碱基已经测序。 读取深度或测序深度表示检测到特定核苷酸的reads数量。这可以作为碱基响应可靠性的有力指标。低读取深度也可能表示样本中的特定区域表现不佳。通常,如果区域/碱基响应有30个读取映射,那么它的读取深度是30倍。读取深度也可以表示为平均读取深度,这是在考虑测序的碱基总数及其单个深度的情况下计算的。通常,排序越深,读取的内容越多。


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