ATAC测序数据中，有哪些重要的质控指标？

库复杂性：库复杂性代表文库中正在测序的读长的数量，它与细胞的数量呈正相关。在ATAC测序中，细胞太少会导致过度转座（或过度消化）产生大量的小片段，而细胞过量会造成转座不足产生大量非常大的片段。碱基质量：碱基响应的质量由分数（PHRED分数）定义，该分数是使用响应核苷酸出错的概率计算的。PHRED分数越高，质量越高，出错的概率越低。比对：一旦碱基响应被编译为reads，就必须将它们准确地与基因组比对。两个指标很好地反映了测序反应的质量。校准率表示映射到基因组上的reads的百分比，最佳值超过90%。比对的质量，或reads与基因组特定区域的匹配程度，被称为MAPQ分数。最高的MAPQ值（255）用于表示单个区域对应的唯一reads，最低的MAPQ值（0）用于表示匹配到许多区域的reads。

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