Cell Ranger与 Seurat软件分析的区别?

    二者侧重不同,Cell Ranger侧重于拆库定量,可以得到cell-gene矩阵,初步的细胞聚类分型结果及cloup可视化软件。Seurat分析基于Cell Ranger结果进行,在参数调整,差异基因展示,细胞周期分析等方面更具优势,可进行数据挖掘。但Seurat结果的可视化操作不佳,需要导入cloup中,而cloup只可通过Cell Ranger获得,所以二者相辅相成,缺一不可。


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