3’转录组与 5’转录组是否可以整合分析?

    理论上是可以的,但需要注意aggr不能矫正不同试剂带来的影响。对单细胞RNA-seq数据中的系统效应或批量效应进行归一化和校正是目前比较活跃的研究领域,目前10x 还没有一个具体的建议。从文献中可以看出,R中有许多包,比如Seurat、scran和scone,试图解决这些问题。


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