fast质控结果中read1的质量和GC含量图分布为什么出现异常?

    1由于10X特殊的实验方式,测序结果read1从起始1bp至16bp为barcode序列,紧接着是10bp(或12bp)的UMI序列,再接着是ploy(dT)VN,由于序列的特殊结构,导致26bp(或28bp)之后的碱基测序质量和GC分布抖动,这是正常现象,而且10x Cell Ranger在分析时read1只用到前26bp(或前28bp)的序列信息,后面序列的信息不会对结果产生影响。


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