TMT定量蛋白质组学技术的优缺点
- TMT 6plex/10plex/16plex/18plex多通道标签选择
- 样本分组设计与实验规划支持
- Orbitrap Fusion Lumos质谱系统，支持MS2与SPS-MS3模式
- 高质量生信分析，包括差异蛋白筛选、富集分析、PPI网络构建等
- 多组学（代谢组/转录组）联合分析服务
TMT定量蛋白质组学因出色的多通道定量能力和稳定的定量重现性，广泛应用于生物标志物筛选、疾病机制研究、药物作用分析等多个生命科学研究领域。TMT 与 iTRAQ 类似，均为基于质谱的等质量同位素标签技术，但在灵敏度、抗干扰能力和平台适配方面展现出不同的技术特点。
一、TMT定量技术原理
TMT技术通过对不同样本中的肽段进行化学等质量标记，在质谱MS/MS阶段释放不同质量的“报告离子”，实现多样本并行定量。
工作流程：
1、样本蛋白提取与酶解；
2、不同TMT标签对样本肽段进行标记（常见如TMT 6plex、10plex、11plex、16plex、18plex）；
3、标记后混合所有样本；
4、LC-MS/MS 分析，在二级质谱中识别出不同标签对应的报告离子强度；
5、报告离子强度反映不同样本中目标肽段的相对含量，进而回推至蛋白层面定量。
TMT标签设计确保标记肽段在一级质谱中等质量表现，在二级质谱碎裂时释放出具有质量差异的reporter离子（例如126–131、或126–134 Da），用于定量。
二、TMT定量蛋白质组学的优势
1、高通量样本并行能力
TMT最多可支持18通道并行分析（TMTpro 18plex），显著提升实验效率和组间比较精度，特别适用于时间序列、多分组、多重复设计的课题。百泰派克生物科技基于 TMTpro 18plex 提供多组样本一体化处理方案，有效降低批次间误差，提高数据可比性。
2、抗干扰能力更强（MS3支持）
TMT定量在MS2级别易受共碎裂干扰（Ratio compression），但TMT配套 Thermo 的Orbitrap Fusion Lumos 等平台支持SPS-MS3 模式（Synchronous Precursor Selection），可显著降低比值压缩问题，提高定量精度。相比iTRAQ，TMT具备更完整的MS3支持方案，更适合高精度定量要求的实验设计。
3、定量重复性高
TMT采用样本标记后混合、统一LC-MS分析的方式，避免了批次差异和进样不一致问题，显著提高了数据一致性和定量重复性。
4、灵敏度高，适用复杂样本
结合高分辨率质谱和纳流液相系统，TMT可实现对复杂生物样本（如血清、组织、细胞系）中中低丰度蛋白的稳定检测与定量，广泛适用于肿瘤、免疫、神经等疾病研究。
三、TMT定量蛋白质组学的缺点
1、Ratio Compression 问题（比值压缩）
在MS2定量中，目标肽段常与背景肽段共碎裂，导致报告离子混杂，真实表达差异被低估。尤其在高复杂度样本中，此现象更为严重。
解决策略：
（1）使用高分辨率Orbitrap Fusion Lumos质谱；
（2）启用 SPS-MS3 模式；
（3）优化肽段前处理与分级策略，减少共碎裂。
2、设备平台依赖性强
TMT对质谱平台要求较高（通常为 Thermo Orbitrap 系列支持度最佳），在非Orbitrap平台上实施困难，限制部分实验室独立开展。
3、标记试剂成本较高
TMT标签价格相对昂贵，尤其在大规模项目（如18通道重复设计）中，整体实验预算相对较高。因此需合理规划样本数量与分组策略，以确保投入产出比最优化。
4、翻译后修饰研究需结合PTM富集
TMT定量标记发生在肽段层面，不保留蛋白结构层面信息。如需研究磷酸化、乙酰化等翻译后修饰（PTM），仍需结合专门的修饰位点富集策略（如TiO₂富集）。百泰派克生物科技支持TMT + PTM联合分析服务，适配肽段标记与修饰位点追踪的技术需求。
四、TMT定量蛋白质组学适用场景
五、百泰派克生物科技：TMT技术一站式解决方案
百泰派克生物科技提供完整的TMT蛋白质组学技术服务，覆盖：
我们通过标准化流程与灵活定制服务，助力科研人员以最优性价比获取高质量、可发表的TMT定量蛋白质组学数据。
TMT技术具有多通道定量能力、较强的数据一致性和较高的抗干扰能力。尽管其成本和平台依赖性需考量，但对于追求数据深度、组间一致性与高精度的科研项目，TMT仍是不可替代的强有力工具。 如您计划开展TMT蛋白质组学项目，或对比TMT/iTRAQ/Label-free等策略的选型有疑问，欢迎联系百泰派克生物科技技术团队，我们将为您定制最合适的实验解决方案。
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