蛋白质定量技术‑TMT标记定量

    在现代生命科学研究中,精确的蛋白质定量是揭示生物学机制、筛选疾病标志物、推动药物研发的核心环节。相比 label-free 定量技术,TMT(Tandem Mass Tag)标记定量因其高通量、多样本并行分析和较低批间偏差,已成为蛋白质组学研究的主流选择之一。本文将从原理、优势、应用到实验设计要点,全方位解析 TMT 标记定量技术。

     

    一、TMT 标记定量定义

    TMT 标记定量是一种基于质谱(MS)的同位素标签相对定量方法。通过将化学标签(Tandem Mass Tags)与不同样本的肽段共价结合,研究者可以在一次 LC-MS/MS 分析中同时检测和定量多达 18 个样本。

    1、TMT 标签的结构

    TMT 标签由三部分组成:

    (1)质量报告基团(Reporter ion) – 在 MS/MS 碎裂时释放特定质量的离子,用于定量;

    (2)质量平衡基团(Balancer) – 确保各标签在 MS1 层面的等质量;

    (3)反应基团(Reactive group) – 与肽段的氨基端或赖氨酸残基共价结合。

     

    2、定量原理

    TMT 通过标签设计,使各个样本的肽段在 MS1 层面质量完全相同,但在 MS/MS 层面释放不同的报告离子,实现多通道的相对定量。

     

    二、TMT 标记定量的优势

    1、高通量与批次一致性

    一次分析可并行处理 10-18 个样本,有效减少批间偏差,是大规模队列研究的理想选择。

     

    2、定量精度高

    由于样本混合后共同进入 LC-MS/MS 分析流程,受实验波动影响较小,适合检测生物学上微小的表达差异。

     

    3、兼容多种研究方向

    (1)基础研究:信号通路解析、翻译后修饰研究;

    (2)临床研究:肿瘤标志物发现、药物作用机制探索;

    (3)多组学整合:可与转录组、代谢组结合,构建系统生物学网络。

     

    三、TMT 标记定量技术典型应用场景

    1、差异蛋白筛选

    比较疾病组与对照组的蛋白质表达,发现候选生物标志物。

     

    2、药物靶点验证

    追踪药物处理前后的蛋白质动态变化。

     

    3、组织与体液蛋白组学

    适用于复杂生物样本(如血浆、脑脊液),探索疾病分子机制。

     

    4、多组学联合研究

    与转录组、代谢组协同,系统揭示疾病网络调控。

     

    四、TMT 标记定量技术实验设计与注意事项

    为了确保 TMT 定量结果的可靠性,实验设计至关重要:

    1、样本量与生物学重复

    建议每组 ≥3 个生物学重复,保证统计学稳健性。

     

    2、蛋白提取与消化

    统一操作流程,避免蛋白降解或消化效率差异。

     

    3、标签分配策略

    随机分配样本至不同 TMT 通道,避免系统性偏差。

     

    4、数据处理与归一化

    使用专业软件(如 Proteome Discoverer)进行信号校正,减少批次效应。

     

    TMT 标记定量凭借高通量和高精度,已成为蛋白质组学研究的核心技术之一。无论是探索疾病机制,还是验证药物靶点,合理设计的 TMT 实验都能显著提升研究效率。如您计划开展大规模蛋白质定量分析,或希望获得高质量的定量结果,欢迎联系百泰派克生物科技,了解我们专业的 TMT 定量解决方案。

     

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    基于TMT的蛋白质组学分析

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