LC-MS蛋白质组学
LC-MS蛋白质组学即利用液相色谱-质谱联用(Liquid chromatography–mass spectrometry,LC-MS)技术进行蛋白质组学分析,包括蛋白质组的定性、定量和翻译后修饰分析。百泰派克生物科技提供基于LC-MS的蛋白质组学分析服务。
液相色谱-质谱联用LC-MS
液相色谱(LC)利用流动相中化合物的重量和与固定相的亲和力的不同而使化合物有效分离。LC是蛋白质和复杂肽等较大的和非挥发性分子的首选分离技术,在对样品进行分析之前使用,并且经常与质谱联用。质谱(MS)通过使样品离子化测量样品离子的质荷比(m/z)以达到分析样品的目的。MS可用于分析多种样品,且是蛋白质组学研究中精确确定肽和蛋白质分子质量以及序列的一个强大工具。由于MS是通过质量来分析化合物的,因此具有相同质量的同分异构体无法通过质谱进行分辨,而液相色谱LC与质谱MS联用则可用于同分异构体的分析。且LC-MS允许在线分离分析复杂混合样品,因此已在蛋白质组学研究中被广泛使用。
LC-MS蛋白质组学
LC-MS蛋白质组学
在基于LC-MS的蛋白质组学研究中,常用到的策略为bottom-up“自下而上”法。与top-down“自上而下”法相比,bottom-up“自下而上”法可用于复杂的蛋白质混合物分析。基于LC-MS的bottom-up“自下而上”蛋白质组学,首先将复杂的蛋白质混合物进行酶切消化;之后将消化后的产物用LC进行分离,以获得相对简单和更均一的肽混合物;最后再使用质谱仪分析分离后的肽产物。LC-MS不仅可用于蛋白质组的定性,还可用于蛋白质组的定量和翻译后修饰分析。
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