百泰派克生物科技BTP客户案例：利用蛋白质谱鉴定对纯化的SARS-CoV-2 nsp12、nsp7和nsp8进行鉴定
期刊：Antimicrobial Agents and Chemotherapy；影响因子: 5.7056
原文链接：DOI: 10.1128/AAC.01508-20
研究对象：SARS-CoV-2 RdRp
研究目的：一种体外非放射性引物延伸测定法的开发研究
研究手段：蛋白质谱鉴定等
研究内容及结论：靶向病毒RNA聚合酶的核苷酸类似物已被证明是抗病毒治疗的一种有效策略，并且是对抗当前SARS-CoV-2大流行的有希望的抗病毒药物。在该研究中，研究人员开发了一种稳健的体外非放射性引物延伸测定法，以定量评估SARS-CoV-2 RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）掺入核苷酸类似物的效率。结果表明，许多核苷酸类似物可以通过SARS-CoV-2 RdRp掺入RNA中，其中一些核苷酸类似物的掺入会导致链终止。测量核苷酸类似物与天然核苷酸的鉴别值，以评估通过SARS-CoV-2 RdRp掺入核苷酸类似物的效率。与文献中发表的数据一致，研究人员发现remdesivir-TP的掺入效率高于ATP，且remdesivir-TP的掺入导致延迟链终止，这可以通过提高下一个要掺入的核苷酸的浓度来克服。数据还表明，remdesivir-TP掺入引起的延迟链终止模式对于不同的模板序列是不同的。在研究的测定条件下，多次掺入remdesivir-TP导致链终止。sofosbuvir-TP的掺入量非常低，这表明sofosbuvir在治疗SARS-CoV-2感染方面可能不是很有效。相比之下，2′-C-甲基-GTP可以有效地掺入RNA中，且2′-C-甲基-GTP的衍生物可能在治疗SARS-CoV-2感染方面有治疗应用。该研究提供了一种简单的筛选方法，可用于评估靶向SARS-CoV-2 RdRp的核苷酸类药物以及研究选定的核苷酸类似物的作用机制。
利用蛋白质谱鉴定对纯化的SARS-CoV-2 nsp12、nsp7和nsp8进行鉴定，该服务由北京百泰派克生物科技提供。
参考文献：Lu G, Zhang X, Zheng W, et al. Development of a simple in vitro assay to identify and evaluate nucleotide analogs against SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase[J]. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2020, 65(1): e01508-20.
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