百泰派克生物科技BTP客户案例：利用HPLC和MS技术分析PVC效应子Pdp1对靶细胞dNTP含量的影响
期刊：Science China Life Sciences；影响因子: 7.5873
原文链接：DOI: 10.1007/s11427-021-1955-4
研究对象：PVC效应子
研究目的：PVC效应子的功能及易位机制研究
研究手段：HPLC检测、MS检测等
研究内容及结论：细胞外收缩注射系统（eCISs）编码在大量细菌和古细菌的基因组中。该研究的研究人员之前已经表征了Photorhabdus Virulence Cassette（PVC）的整体结构，PVC是eCIS家族的一个典型成员。PVC类似于噬菌体的收缩尾巴，通过外鞘收缩和内管加中心尖刺注射来发挥作用。然而，PVC效应子的生物学功能和效应子易位的机制尚不清楚。通过结合冷冻电镜和功能实验，研究人员发现PVC效应子Pdp1（eCIS中广泛存在的dNTP焦磷酸酶效应子的一个新家族）和Pnf（一种脱酰胺酶效应子）以“Peas in the Pod”模式加载在内管腔内。此外，研究人员观察到Pdp1和Pnf可以直接被注射到J774A.1小鼠巨噬细胞中，并分别通过破坏dNTP池和肌动蛋白细胞骨架形成杀死靶细胞。该研究结果提供了PVC货物如何装载并直接输送到哺乳动物巨噬细胞中的直接证据。
利用HPLC和MS技术测定转染等量Pdp1突变体的 HEK293T细胞中的dNTP含量，该服务由北京百泰派克生物科技提供。结果发现，在产生WT Pdp1的细胞中胞内核苷酸水平显著降低了。相比之下，在Pdp1突变体转染的细胞中dNTPs的浓度或多或少地恢复了。这些结果表明，Pdp1通过其焦磷酸酶活性破坏细胞内dNTP池，在影响细胞活力方面发挥关键作用。
参考文献：Wang X, Cheng J, Shen J, et al. Characterization of photorhabdus virulence cassette as a causative agent in the emerging pathogen photorhabdus asymbiotica[J]. Science China Life Sciences, 2022, 65(3): 618-630.
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