【送样指南】百泰派克蛋白组学、代谢组学样本量&样本采集及运输要求
一、送样量要求
1. 定性蛋白质组1.1. 常规定性蛋白质组
| 样本类型 | 送样标准 |
|---|---|
| 胶点/胶条 | 考染或银染的胶点或胶条，要求考染条带肉眼隐约可见，银染条带清晰可见，无降解，长度为目的条带或1-2 cm长泳道。放置在EP管中，加入0.5-1 mL ddH₂O，使得胶条湿润，4℃保存，冰袋运输。 |
| 蛋白溶液 | 20 μg蛋白溶液，需提前告知溶液成分，避免干扰后续实验。干冰寄送 |
| FFPE（石蜡切片） | 5-10 μm厚、50 mm²大小，10片以上，常温运输。 |
1.2. 互作定性蛋白质组
| Co-IP/Pull-down | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 样本类型 | 仅质谱鉴定 | 互作+质谱 | 互作+质谱+WB | |||
| 推荐送样量 | 最低送样量 | 推荐送样量 | 最低送样量 | 推荐送样量 | 最低送样量 | |
| 胶点/胶条 | 同常规定性产品要求 | / |
/ | |||
| 琼脂糖Beads/磁珠 | 20-30 μL | / | / | |||
| 蛋白溶液 | 10 μg | 5 μg | 1000 μg | 500 μg | 2000 μg | 1000 μg |
| 组织样本 | 同LFQ要求 | 同磷酸化要求 | 同磷酸化要求 | |||
注：除胶点胶条冰袋运输、FFPE样本常温运输，其他所有样本均为干冰寄送。
2. 蛋白质定量组
2.1. 常规蛋白质组（Label Free/DIA/TMT）
| 样本类型 | 推荐送样量 | 最少送样量 | |
|---|---|---|---|
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 20 mg | 10 mg |
| 坚硬动物组织（骨头、软骨、毛发等） | 100 mg | 50 mg | |
| 肿瘤组织（癌或癌膀等包含结缔组织的样本） | 30 mg | 15 mg | |
| 植物组织 | 常规植物组织（木本植物的叶、花等，草本植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等柔软组织） | 2 g | 1 g |
| 坚硬植物组织（根、树皮、树枝、果实种子等） | 5 g | 2 g | |
| 花粉 | 100 mg | 50 mg |
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞/悬浮细胞 | 1×10^7 | 2×10^6 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 | 50 mg 或者 50 μL | 20 mg 或者 20 μL |
| 体液类 |
血清/血浆（不去高丰度） | 10 μL | 5 μL |
| 血清/血浆（去高丰度） | 50 μL | 25 μL | |
| 尿液 | 1 mL | 0.5 mL | |
| 脑脊液 | 0.1 mL | 0.05 mL | |
| 乳汁 | 0.5 mL | 0.2 mL | |
| 唾液 | 0.2 mL | 0.1 mL | |
| 泪液 | 0.2 mL | 0.1 mL | |
| 房水/玻璃体液 | 0.1 mL | 0.05 mL | |
| 肺泡灌洗液 | 1 mL | 0.5 mL | |
| 培养上清 | 发酵液上清/细胞培养上清 | 10 mL | 5 mL |
| FFPE | 石蜡切片 | 20片 | 10片 |
| 福尔马林固定组织 | 30 mg | 15 mg | |
| 蛋白溶液 | 客户自行提取的蛋白溶液，需要提前告知蛋白溶液成分 | 20 μL | 10 μL |
注：4D蛋白质组只是在质谱采集上增加离子淌度的维度，前处理同3D蛋白质组，送样标准不变。
2.2. 修饰蛋白质组
| 样本类型 | 磷酸化/糖基化 | 乙酰化/泛素化/苏木化/乳酸化/甲基化 | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | 推荐送样量 | 最少送样量 | ||
| 动物组织 |
常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 100 mg | 50 mg | 200 mg | 100 mg |
| 坚硬动物组织（骨头、软骨、毛发等） | 5 g | 3 g | 10 g | 5 g | |
| 肿瘤组织（癌或癌膀等包含结缔组织的样本） | 100 mg | 50 mg | 200 mg | 100 mg | |
| 植物组织 |
常规植物组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等柔软组织） | 2 g | 1 g | 10 g | 5 g |
| 坚硬植物组织（根、树皮、树枝、果实种子等） | 5 g | 2 g | 10 g | 5 g | |
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞/悬浮细胞 | 2×10^7 | 1×10^7 | 1×10^8 | 5×10^7 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 |
500 μL 或者 500 mg |
250 μL 或者 250 mg |
500 μL | 250 μL |
| 体液类 |
血清/血浆（不去高丰度） | 50 μL | 20 μL | 100 μL | 50 μL |
| 客户自行提取的蛋白溶液，需要提前告知蛋白溶液成分 | 2 mg | 500 μL |
/ |
||
| 蛋白溶液 | 客户自行提取的蛋白溶液，需要提前告知蛋白溶液成分 | 2 mg | 1 mg |
5 mg |
2 mg |
2.3. 微量蛋白质组
| 样本类型 | 样本量 | |
|---|---|---|
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 2 mg |
| 肿瘤组织（癌或癌膀等包含结缔组织的样本） | 10 mg | |
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞/悬浮细胞 | 1000个 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 | 20 μL |
| 体液类 |
血清/血浆（不去高丰度） | 5 μL |
| 血清/血浆（去高丰度） | 10 μL | |
| 尿液 | 500 μL | |
| 脑脊液 | 100 μL | |
| 乳汁 | 200 μL | |
| 唾液 | 200 μL | |
| 泪液 | 200 μL | |
| 房水/玻璃体液 | 100 μL | |
| 肺泡灌洗液 | 1 mL | |
| FFPE | 石蜡切片 | 10片 |
| 福尔马林固定组织 | 10 mg | |
| 蛋白溶液 | 客户自行提取的蛋白溶液，需要提前告知蛋白溶液成分 | 10 μg |
注：微量蛋白质组不提供电泳结果，存在一定实验失败风险。
3. 特殊蛋白质组
3.1. 化学蛋白质组（药靶）
| 样本类型 | DARTS/LIP MS |  |
|||
|---|---|---|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | 推荐送样量 | 最少送样量 | ||
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 20 mg | 10 mg | 30 mg | 20 mg |
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞 / 悬浮细胞 | 1×10^7 | 5×10^6 | 1×10^7 | 5×10^6 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 | 50 μL | 20 μL | 100 μL | 50 μL |
| 蛋白溶液 | 客户自行提取的蛋白溶液，要求使用非变性方式提取，提前告知蛋白溶液成分。 | 100 μg | 50 μg | 100 μg | 50 μg |
3.2. 宏蛋白质组
| 样本类型 | 宏蛋白质组 | |
|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | |
| 粪便 | 5 g | 2 g |
| 肠道内容物 | 5 g | 2 g |
| 土壤 / 污泥 / 沙子 | 10 g | 5 g |
| 发酵物残渣 | 10 g | 5 g |
| 污水 / 海水 | 0.5 L | 0.3 L |
注：宏蛋白组默认采集模式DIA，需提供宏基因组数据库或同时委托宏基因组+宏蛋白组项目。
3.3. 外泌体蛋白质组
| 样本类型 | 外泌体表征 | 外泌体组学 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 电镜 | 粒径 | 流式检测 (每个指标) | WB (每个指标) | 蛋白组 (LFQ) | 代谢组 | RNA 测序 | |
| 血清 / 血浆 | 0.3 mL | 0.3 mL | 0.5 mL | 0.5 mL | 1 mL | 4 mL | 4 mL |
| 细胞上清 | 10 mL | 10 mL | 20 mL | 50 mL | 50 mL | 50 mL | 50 mL |
| 尿液 | 5 mL | 5 mL | 10 mL | 25 mL | 10 mL | 50 mL | 50 mL |
| 脑脊液 | 2 mL | 2 mL | 4 mL | 4 mL | 10 mL | 15 mL | 15 mL |
| 精液 / 精浆 | 0.3 mL | 0.3 mL | 0.5 mL | 0.5 mL | 0.5 mL | 5 mL | 5 mL |
| 动物组织 | 1 g | 1 g | 2 g | 2 g | 3 g | 6 g | 3 g |
| 外泌体 | 15 μL | 15 μL | 20 μL | 20 μL | 50 μL | 100 μL | 100 μL |
注：外泌体表征可选择客户关注的目标执行，具体送样量按照执行情况提供。
4. 多肽组
| 样本类型 | 多肽鉴定 / 组学 | 免疫肽 | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | 推荐送样量 | 最少送样量 | ||
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 50 mg | 25 mg | 200 mg | 50 mg |
| 坚硬动物组织（骨头、软骨、毛发等） | 100 mg | 50 mg | 2 g | 1 g | |
| 肿瘤组织（癌或癌膀等包含结缔组织的样本） | 60 mg | 30 mg | 200 mg | 100 mg | |
| 植物组织 | 常规植物组织（木本植物的叶、花等，草本植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等柔软组织） | 1 g | 500 mg | / | |
| 坚硬植物组织（根、树皮、树枝、果实种子等） | 5 g | 2 g | |||
| 花粉 | 200 mg | 100 mg | |||
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞 / 悬浮细胞 | 1×10^7 | 5×10^6 | 1×10^7 | 5×10^6 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 | 100 μL | 50 μL | / | |
| 体液类 | 血清 / 血浆 | 100 μL | 50 μL | 500 μL | 300 μL |
| 尿液 | 2 mL | 1 mL | / | ||
| 培养上清 | 发酵液上清 / 细胞培养上清 | 10 mL | 5 mL | ||
| 蛋白溶液 | 客户自行提取的蛋白溶液，需要提前告知蛋白溶液成分 | 100 μg | 50 μg | / | |
5. 代谢组
5.1. 非靶代谢
| 样本类型 |
非靶代谢 (LC)/ 中药非靶代谢 /小分子物质鉴定 |
非靶代谢 (GC) | 非靶脂质 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | 推荐送样量 | 最少送样量 | 推荐送样量 | 最少送样量 | ||
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 100 mg | 50 mg | 30 mg | 20 mg | 30 mg | 20 mg |
| 植物组织 | 常规植物组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等柔软组） | 200 mg | 100 mg | 200 mg | 100 mg | 200 mg | 100 mg |
| 细胞沉淀 | 贴壁细胞 / 悬浮细胞 | 1×10^7 | 5×10^6 | 1×10^7 | 5×10^6 | 1×10^7 | 5×10^6 |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体等菌体沉淀 | 200 μL | 100 μL | 100 μL | 50 μL | 100 μL | 50 μL |
| 体液类 | 血清 / 血浆 | 200 μL | 100 μL | 10 μL | 5 μL | 100 μL | 50 μL |
| 尿液 | 2 mL | 1 mL | 2 mL | 1 mL | 2 mL | 1 mL | |
| 脑脊液 | 2 mL | 1 mL | 0.2 mL | 0.1 mL | 2 mL | 1 mL | |
| 泪液 | 2 mL | 1 mL | 0.5 mL | 0.2 mL | 2 mL | 1 mL | |
| 培养上清 | 发酵液上清 / 细胞培养上清 | 2 mL | 1 mL | 20 mL | 10 mL | 2 mL | 1 mL |
| 粪便 / 肠道内容物 | 200 mg | 100 mg | 20 mL | 10 mL | 200 mg | 100 mg | |
5.2. 靶向代谢
| 样本类型 | 广泛靶向代谢组学 | ||
|---|---|---|---|
| 推荐送样量 | 最少送样量 | ||
| 动物组织 | 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等柔软组织） | 100 mg | 50 mg |
| 植物组织 | 常规植物组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等柔软组织） | 200 mg | 100 mg |
| 其他 | 同 “非靶代谢（LC）” | ||
二、样本收集指南
1. 样本采集&运输要求
（1）采集和运输过程中严格按照要求温度保存。同一份样本做多组学时，建议在取样环节进行分装，避免反复冻融；
（2）样本采集过程用水为超纯水，涉及有机试剂建议色谱纯级别以上；
（3）样本采集中使用离心管应为优质材料，装填样本后用足量封口膜缠好，避免过程中样本泄露或引入杂质（推荐品牌：Eppendorf，Axygen，Corning等）；
（4）由于部分仪器和软件不识别中文和特殊字符，样本名称尽量使用英文，如需字符可使用“_”；
（5）样本标记用油性记号笔标记，尽量标记多处，用减震材料包裹，避免低温运输过程中发生破损；
（6）使用双层泡沫盒运输样本，加入足量干冰。夏季需要 5kg 干冰/天，冬季需要 4kg 干冰/天，根据快递时效准备干冰。
2. 动物组织样本
2.1. 常规动物组织（脑、心、肝、脾、肾、肺等）
（1）准确切取所需组织后，迅速剔除脂肪和结缔组织等非研究所需的组织类型，将组织分割成 20-50 mg 小块（约黄豆大小）；
（2）在生理盐水或 PBS 中迅速漂洗样本，以去除血渍和污物；
（3）用镊子夹住样本转移至提前标记好的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
注：肿瘤组织要根据病理条件切块，癌旁组织远离病灶 2 cm 以上。
2.2. 坚硬动物组织（骨头、软骨等）
（1）PBS 洗涤，用手术刀将软骨切成 1cm3 左右的小块；
（2）转移至有标记的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
2.3. 坚硬动物组织（毛发）
（1）用适量 2% SDS，50mM 磷酸钠（pH7.8）缓冲液漂洗样品，去除污染物；
（2）干燥样本，转移至有标记的离心管中，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
2.4. 软体动物 (血吸虫、旋毛虫等)
（1）收集样本，用预冷的 PBS 去除宿主污染物；
（2）转移至有标记的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3. 植物组织样本
3.1. 常规植物组织（叶、花、果实、种子、树根、树皮等及蕨类等）
（1）取特定部位组织，去除非目标组织，冲洗掉尘土和明显杂质，无尘纸擦干；
（2）锡纸包裹或者放入离心管，做好标记后液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3.2. 花粉
（1）植物开花期收集花粉，解剖显微镜下检查花粉，用解剖针去除花药碎片等杂质，转入 EP 管中；
（2）光学显微镜下检查花粉的形态和纯度，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
3.3. 藻类
（1）根据不同的藻类采取合适的离心力，分离藻类同时保证细胞完整，PBS 洗涤 2-3 次，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（2）干冰寄送，避免反复冻融。
4. 细胞样本
4.1. 悬浮细胞
（1）1000 g，离心 10 min，收集悬浮细胞，弃培养上清；
（2）用预冷的 PBS 溶液洗 2-3 遍，离心弃上清，收集细胞沉淀于 1.5mL 离心管中；
（3）液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
4.2. 贴壁细胞
（1）弃培养基，将培养皿倒扣至吸水纸上，将液体控干；
（2）加入 4℃预冷的 PBS，平放轻轻摇动 1 min，洗涤细胞，弃去 PBS。 重复以上两步操作 2 次以弃去培养液；
（3）将培养皿置于冰上，胰蛋白酶消化后，加入预冷的 PBS 重悬细胞；
（4）将细胞悬液收集到 15 mL 离心管中，4℃，1000 g 离心 10 min，弃除PBS；
（5）1mL PBS 重悬细胞后转移到新的 1.5 mL 离心管中，离心弃除 PBS，保留细胞沉淀，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
5. 液体类样本
5.1. 血清
（1）使用真空采血管收集血液（不含抗凝剂，推荐红盖）或收集全血到洁净的离心管中；
（2）轻柔上下颠倒混匀 8-10 次，4℃，静置 30 min；
（3）4℃，1000 g 离心 10 min；
（4）用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中，混匀，瞬时离心；
（5）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，- 80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
5.2. 血浆
（1）使用真空采血管收集血液（含抗凝剂，推荐紫盖，含 EDTA 抗凝剂）或收集全血到含抗凝剂的离心管中；
（2）轻轻地上下颠倒混匀 8-10 次；
（3）4℃，1000 g 离心 10 min；
（4）用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中，混匀，瞬时离心；
（5）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，- 80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
注：血清/血浆样本采集时，保证动作轻柔，避免溶血。样本颜色为澄清透亮的黄色，如发现有粉色或红色，证明存在溶血污染，对后续结果有一定影响。
5.3. 尿液样本
（1）采集受试者晨起后的中段尿液，于 4℃临时保存（不得超过 8 h），注意避免细菌污染，收集前注意对饮食的控制；
（2）4℃，1000 g 离心 15min，去除细胞或细胞碎片；
（3）取上清至新的离心管中，分装 1mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
5.4. 乳汁、腹水
（1）按照临床采集方法，采集乳汁、腹水样本于离心管中；
（2）按照实验需求分装 1mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
5.5. 脑脊液、淋巴液、关节液、穿刺液
（1）按照临床采集方法，采集样本于离心管中；
（2）4℃，1000g~2000 g 离心 5min；
（3）取上清使用 0.22μm 滤膜（可选）过滤，收集流穿液；
（4）按照实验需求分装 100μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存。
5.6. 唾液样本
（1）禁食两小时以上，9-12 a.m.时段取样；
（2）4℃，1000g~2000 g 离心 5min；
（3）取上清使用 0.22μm 滤膜（可选）过滤，收集流穿液；
（4）按照实验需求分装 100-200μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（5）干冰寄送，避免反复冻融。
5.7. 泪液样本
（1）使用毛细管微量移液管收集样品，4℃，8000-14000 g 离心 5min；
（2）取上清至离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
5.8. 细胞培养基上清
（1）参考细胞收集方法，去除原有培养基，收集细胞；
（2）使用无血清培养基继续培养细胞。细胞继续培养 24-48 小时（根据细胞的生长速度确定收取上清时间）；
（3）300 g，4°C，离心 10 min，取上清至 15mL 离心管中；
（4）4°C，3000 g，离心 15 min，去除多余的细胞碎片；
（5）将上清样本转移至新的离心管中，分装 5-10mL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（6）干冰寄送，避免反复冻融。
注：含血清的培养基会在后续实验中引入高丰度蛋白，导致鉴定数量大量降低。
6. 微生物
（1）4℃，5000g 离心 15min，弃上清；
（2）用预冷的 PBS 重悬菌体沉淀，再次离心弃上清，重复 3 次；
（3）收集菌体沉淀至新的离心管中，按照实验需求分装 50-100μL/管，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
7. 粪便、肠道内容物
7.1. 粪便
（1）粪便排出后，使用取样勺取中段转移至有标记的离心管中；
（2）按照实验需求对样品进行分装，每管均为100~500 mg，液氮速冻10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
7.2. 肠道内容物
（1）取出整个肠道，切取目标区域肠道，纵向切开肠道，使肠道内容物暴露出来；
（2）使用无菌取样器收取肠道内容物到有标记的离心管中（尽可能取到到肠道深处，但避免取到肠道表皮组织和血液等杂质）；
（3）按照实验需求对样品进行分装，每管均为100~500 mg，液氮速冻10min，-80℃保存；
（4）干冰寄送，避免反复冻融。
8. 环境样本
8.1. 土壤
（1）挖取地下 5~20cm 的土层，去除可见杂质；
（2）土壤过 2mm 筛网，分装 5-10g/管到新的离心管中，液氮速冻 10min，-80℃保存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
8.2. 水体
（1）采集所需水体样本，静置 24h，弃除污泥等大颗粒杂志；
（2）取上清过 0.22μm/0.45μm 滤膜，保留滤膜，-80℃冻存；
（3）干冰寄送，避免反复冻融。
注：
①0.45μm 截取真菌及直径更大的微生物，0.22μm 截取细菌及直径更大的微生物，客户根据研究目的选取对应的滤膜；
②滤膜冷冻后变脆易碎，建议样本收集后尽快开展实验。
9. 发酵物残渣（大曲、酒醅、作物等）
（1）收集样本，分装 2-5g/管至离心管中，-80℃保存；
（2）干冰寄送，避免反复冻融。
How to order?
