10X单细胞测序中GEM是什么意思？

在10x Genomics单细胞测序中，GEM（Gel Bead-in-Emulsion）是一种关键的组件，指的是将凝胶珠包裹在微滴（乳状液）中的结构。GEM技术是10x Genomics单细胞测序中实现单细胞分离和mRNA捕获的核心步骤。

凝胶珠上带有预合成的寡核苷酸探针，包含一个独特的细胞条形码、一个UMI（独特分子标识符）以及一个聚A尾部分。当一个细胞和一个凝胶珠被一起封装在一个微滴（油包水乳状液）中时，细胞破裂释放mRNA，mRNA与凝胶珠上的寡核苷酸探针结合。这一过程使得每个捕获到的mRNA分子都带有特定的细胞条形码和UMI，从而可以在后续的数据分析中准确地追溯到原始的单个细胞。

GEM技术对于10x Genomics单细胞测序的成功至关重要，因为它允许在单细胞水平上分析成千上万个细胞，为深入了解生物系统提供了前所未有的高分辨率信息。