高通量基因敲除后蛋白组学分析

蛋白质组学是一门研究生物体内所有蛋白质的组成、结构、功能以及相互作用的科学领域，它的目标是建立全面的蛋白质清单，并理解它们在生命过程中的作用。但是，目前被充分研究了生物学功能的蛋白质仍然较少，一些蛋白质编码基因仍然没有相关的注释，非同义单核苷酸多态性以及选择性剪接和翻译后修饰过程产生的大量蛋白质类型也使这一研究变得更为困难。高通量基因敲除技术的出现为大规模蛋白质和蛋白质形态检测提供了强有力的工具。高通量基因敲除技术可以用来沉默或敲除特定基因，进而观察蛋白质组中的变化，结合高分辨率质谱技术，可以用来分析蛋白质的组成、修饰和相对丰度。

Dolgalev G,et al. Genes. 2021.

高通量基因敲除技术在蛋白质组学中的应用

高通量基因敲除技术和蛋白质组学的结合为生物学研究提供了全新的视角。通过结合这两种技术，研究人员可以研究特定基因敲除对蛋白质组的影响，识别与被敲除基因相关的蛋白质，从而更好地理解基因与蛋白质之间的相互作用，揭示蛋白质调控网络。例如，研究人员可以确定特定基因的敲除如何影响癌细胞中的蛋白质表达，从而寻找新的癌症治疗方法。此外，这种结合还可以用于研究神经退行性疾病、免疫疾病和代谢紊乱等多种疾病的机制。

百泰派克生物科技（BTP）基于高分辨率蛋白质组学分析平台，结合高通量基因敲除技术，可以为您提供从基因敲除到蛋白质组分析的整体方案。我们优化的CRISPR/Cas9系统可实现人/小鼠细胞系、原代细胞、免疫细胞及iPS细胞的单/多基因敲除、移码突变和大序列敲除。获得KO细胞后对其进行培养并提取KO细胞表达的蛋白质，利用高分辨质谱平台进行蛋白组分析，通过对蛋白质组成及水平的鉴定解释特定敲除基因在蛋白质水平上的作用，揭示基因调控蛋白质的机制。BTP自建7大检测平台，拥有CNAS/ISO9001双重质量体系认证实验室，旨在为您提供最优质的科研服务，我们期待与您的合作，欢迎免费联系我们，了解更多服务详情！

服务优势

1）敲除效率保证：优化的CRISPR/Cas9系统，超过80%靶点敲除效率在70%；基因敲除后，我们采用Sanger测序和深度蛋白质组学技术对敲除效率进行双验证，双重保障数据的真实性。

2）完善的蛋白质组学分析平台：我们的蛋白质组学分析平台配备完善的样品前处理仪器、高特异性蛋白修饰富集平台、超高效液相色谱高分辨质谱联用以及蛋白N端序列分析仪，可实现组学水平上蛋白质的高效提取、特定修饰肽段的高效富集以及蛋白的鉴定、相对定量（3D & 4D）和绝对定量分析，能对KO细胞表达的蛋白质组进行全面的分析。

3）项目周期短：在进行基因敲除实验前，我们会对不同细胞中基因必要性及表达量进行分析，确保实验的可行性，降低实验失败风险；且无需针对客户的靶点设计预实验进行gRNA验证，大大缩短了项目周期。

4）一站式服务：BTP拥有丰富的组学服务经验以及专业的技术人员，可以根据您的需求定制最优的项目方案，您只需将您的实验目的告诉我们并寄送样品，BTP负责所有项目后续，包括样品处理、实验分析、数据分析和项目报告。

应用领域

1.疾病机理研究

通过敲除特定基因，研究人员可以观察疾病状态下的蛋白质表达和调控变化。例如，在癌症研究中，通过敲除与癌症发展相关的基因，可以更好地理解肿瘤的生物学机制。

2.药物靶标发现

通过分析基因敲除对蛋白质组的影响识别新的药物靶标。例如，在寻找治疗阿尔茨海默病的新药物时，研究人员可以通过敲除与认知功能下降相关的基因来寻找潜在的治疗靶点。

3.功能基因组学研究

结合基因敲除技术和蛋白质组学研究基因和蛋白质在细胞中的功能，以及它们如何相互作用来调控生物过程。

4.系统生物学

在系统生物学领域，结合基因敲除技术和蛋白质组学建立蛋白质-蛋白质相互作用网络，帮助理解复杂的生物系统。例如，研究人员通过分析特定病理条件下的蛋白质组变化揭示疾病过程中的关键调控网络。

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