蛋白质质谱分析流程
目前,酶解、液相色谱分离、串联质谱及计算机算法的联合应用已成为鉴定蛋白质的趋势,通过质谱鉴定氨基酸序列来匹配相应的蛋白质可对蛋白质进行定性研究,是蛋白质组学研究的基础。目前,蛋白质质谱主要测定蛋白质一级结构,包括分子量、肽链氨基酸排序及二硫键数目和位置,其分析流程如下所述。
通过实验准备所需的样本细胞,再经过分离提纯得到蛋白质样本,包括单一蛋白质(纯化蛋白、2-DE/DIGE凝胶胶点、SDS-PAGE单一条带)、全谱蛋白质(完整组织、体液或者提取物)、混合蛋白质(蛋白混合液、WB条带、Co-IP和Pull-down产物)。
使用蛋白酶消化蛋白质使之成为含有6-20个氨基酸的肽段。将酶解得到的肽段进行上机检测分析,通过质谱仪检测多肽的指纹图谱。
分析所得蛋白质图谱,蛋白质的准确定性需要根据数据库搜索策略进行辅助鉴定,利用软件检索蛋白质数据库对实际检测蛋白质谱图与理论蛋白质谱图进行匹配计算,可以搜索最好的匹配质谱图所对应的多肽从而完成蛋白质鉴定。
百泰派克生物科技采用Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,能够对各种样品中的蛋白质进行高效精准的蛋白质谱鉴定服务以及蛋白质组学相关服务。您只需要将您的需求和样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括样品前处理、质谱分析、质谱原始数据分析和组学分析。
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