用DIA技术解读乳酰化修饰与疾病机制的深度关联

    乳酸早年被视为“代谢废物”,如今却被认为是细胞命运的重要信号分子。特别是在2019年组蛋白乳酰化(Histone lactylation)首次被发现之后,乳酰化作为一种赖氨酸翻译后修饰(PTM),迅速受到生物医学界关注。它在调节免疫应答、肿瘤代谢重编程、慢性炎症反应等过程中展现出重要作用。然而,要全面解析乳酰化在疾病中的功能网络,研究者需要突破三个技术难点:

    1、乳酰化修饰丰度低、难以稳定检测

    2、功能蛋白广泛、作用复杂、难以定量解析

    3、疾病状态下变化微妙、需大规模比较分析

     

    在这一背景下,DIA技术(数据非依赖采集)凭借其高重复性、高通量、深覆盖和全面定量能力,已成为乳酰化修饰组学研究中的关键工具。

     

    一、什么是DIA技术?为什么它适合研究乳酰化?

    DIA是一种全扫描质谱策略,它通过系统性分段扫描所有肽段,而非仅挑选高丰度信号进行碎裂(如DDA)。这意味着:

    1、每一次上机都能全面、稳定记录所有可检测肽段,极大提升数据一致性与定量准确度;

    2、特别适用于复杂PTM样本中低丰度肽段的全面检测与定量分析;

    3、可用于构建乳酰化修饰蛋白在健康与疾病状态下的全景图谱。

     

    DIA技术相比DDA的优势概括如下:

     

    protein-lactylation-modification-analysis-zh4-1

     

    二、DIA技术在乳酰化修饰研究中的关键应用场景

    1、疾病状态下乳酰化蛋白谱的系统构建

    通过对疾病模型(如肿瘤组织、炎症细胞、缺氧处理)与对照组的乳酰化肽段富集后进行DIA质谱分析,研究者可以:

    (1)系统识别乳酰化修饰蛋白及修饰位点;

    (2)量化各修饰位点在不同处理条件下的表达变化;

    (3)构建疾病状态下的乳酰化功能蛋白网络。

     

    2、揭示乳酰化参与的通路与调控轴

    DIA数据可结合生物信息学工具进行GO、KEGG分析,帮助研究者识别乳酰化高富集的:

    (1)代谢通路(糖酵解、脂代谢)

    (2)炎症通路(NF-κB、JAK-STAT)

    (3)细胞周期/凋亡路径

    (4)染色质重塑与转录调控网络

     

    这对于理解乳酰化如何参与细胞表型转变、肿瘤侵袭性增强、免疫失衡等疾病机制具有重要意义。

     

    3、多组学整合:乳酰化与表达/代谢/信号协同分析

    将乳酰化-DIA数据与转录组、代谢组、磷酸化组等多组学数据整合,可以构建跨层级调控模型。

     

    三、技术流程:DIA乳酰化修饰蛋白质组学分析路径

    1、样本准备与乳酰化肽富集

    • 样本来源:细胞/组织/血液等

    • 酶解策略:FASP/S-Trap

    • Kla富集:特异性抗乳酰化抗体结合磁珠富集

     

    2、DIA质谱采集

    • 仪器:Orbitrap Exploris 480 / timsTOF Pro

    • 扫描模式:覆盖300–1,200 m/z,全段碎裂

    • 条件优化:窗口数、碰撞能设置基于乳酰化肽特性微调

     

    3、数据分析平台

    • 肽段/位点鉴定:Spectronaut / DIA-NN

    • 修饰定量与归一化:MaxLFQ / MSstats

    • 功能注释与通路分析:DAVID、Metascape、Cytoscape等

     

    百泰派克生物科技的技术方案与优势

    在乳酰化DIA组学研究中,百泰派克生物科技提供从样本处理、乳酰化富集、DIA质谱采集到系统生物信息分析的一站式服务:

     

    protein-lactylation-modification-analysis-zh4-2

     

    乳酰化修饰所揭示的,不仅是一个新的蛋白修饰标签,更是一种代谢-表观遗传-信号网络调控的“语言”。通过高分辨率、深覆盖和高度可重复的数据获取能力,DIA技术使得乳酰化蛋白组学从“能检测”迈入“能解释”的新阶段。未来,这一技术组合将在肿瘤标志物发现、炎症机制研究、药物靶点筛选等领域,发挥不可替代的作用。百泰派克生物科技将持续投入于DIA平台优化与PTM组学拓展,为科研人员提供最前沿的蛋白质组学解决方案,加速基础研究向疾病干预的转化。如您计划开展乳酰化相关疾病机制研究,或需要定制化DIA组学实验方案,欢迎联系百泰派克生物科技,获取免费咨询与项目支持。

     

    百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

    相关服务:

    蛋白质乳酸化修饰

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