PRM定量蛋白质组学原理
PRM (Parallel Reaction Monitoring, 平行反应监测) 是基于高分辨质诊技术的一种靶对性定量方法，已成为生命科学领域高级定量分析的重要工具。与经典的 SRM (选择反应监测) 相比，PRM定量蛋白质组学应用了 Orbitrap 或 TOF 类型质谱仪，对细分结构进行全路径监测，达到更高的选择性、灵敏性和可重复性。
一、PRM定量蛋白质组学工作原理解析
1、定向肽段选择
PRM分析的首步，是根据前期 DDA 数据、论文报道或数据库，选出目标蛋白的特密肽段 (signature peptides)，这些肽段是定量的基本单位。
2、前体离子筛选
通过质诊的四极杆经典选择系统，PRM选择进入超高分辨组件的前体离子。
3、热解压碎
将前体离子选入后进行 HCD (Higher-energy Collisional Dissociation)，得到一组特征性的产物离子。
4、全路径被加解析
PRM将全部产物离子给予全路径分析，通过Orbitrap 或 TOF质谱仪进行高分辨、高精度扫描，达到基于多个离子相关定量的精确性和可靠性。
二、PRM定量蛋白质组学相比SRM的技术优势
1、高分辨+全路径=极致选择性
（1）PRM不再像SRM那样预设多个离子对，而是直接全路径分析所有产物离子，同时通过高分辨质诊进行分析，大大降低了肽段间相互干扰的可能。无需为每个肽段调优反应链，方法开发更简单
（2）PRM只需选定前体肽段，所有离子自动分析，维护成本和调试复杂度较SRM大带降。
2、相对实现绝对定量
PRM定量蛋白质组学可与同位素标记肽段 (Stable Isotope-labeled Standards) 结合使用，实现绝对定量，在标志物衡量碳副术中特别重要。
3、高信息量全路径元数据
可以在后续分析中实现更多功能，包括重分析、重复扫描、多角度数据核查等。
三、PRM定量蛋白质组学应用场景
1、疾病标志物验证
PRM可对 Discovery 阶段筛选出的候选疾病标志物进行高精度定量，方便分析其在大量临床样本中表达的稳定性、重复性和特密性。
2、信号通路方法定量
PRM特别适合针对特定信号通路中的关键蛋白进行实验验证，支持分子机制研究或药效通路分析。
3、生物药质量控制
在抗体药成分和劑效极低衡量分析中，PRM 可实现对特定表达量或修饰位点的非常精确量化。
4、比较 DIA的高灵活性
不同于静态 DIA 依赖整体相应的库，PRM更加灵活，可根据新发现简单选定新肽段，调整频段或日后扫描缩缶。
百泰派克生物科技配备高速 Orbitrap Exploris 480 系统，配合自己建立的肽段库，提供从成像设计、肽段选择、同位素标记配置到数据解析的一维化PRM定量蛋白质组学服务。我们的规范化流程已应用于拥有百余项相关合作项目，要素包括肿瘤定量、免疫控制、疾病标志验证、药效PK分析等，达到高选择性和高可重复性的数据达标。若您需要专属于自己研究问题的 PRM 定量解决方案，或希望联系我们进行互动，欢迎登陆我们官网或直接联系客服团队，我们将为您提供专业化的技术指导和一对一解决方案。
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