Olink NPX 值代表什么?如何正确解读蛋白表达数据

    在基于Proximity Extension Assay(PEA)的Olink蛋白组学分析中,研究人员获取的主要结果指标是NPX(Normalized Protein eXpression)值。NPX是Olink特有的数据单位,用于反映蛋白相对丰度,经过严格的标准化、背景扣除和对数转换,可实现跨样本和批次的比较。正确理解NPX的含义与解读方法,是确保生物标志物筛选和后续研究可靠性的关键。

     

    一、NPX值的基本概念

    1、NPX的定义

    (1)NPX是Olink专有的数据单位,用于表示目标蛋白的相对丰度;

    (2)它基于原始信号(qPCR的Cq值或NGS的标签计数),经过归一化处理、背景扣除、对数2转换后得到;

    (3)数值单位通常为“log2 scale”,数值越高,蛋白相对丰度越高。

     

    2、NPX不是绝对浓度

    (1)NPX反映样本间相对变化,但无法直接对应具体的pg/mL或ng/mL浓度;

    (2) 如需绝对定量,需要借助外部标准品或结合其他检测手段(如ELISA、质谱)进行校准。

     

    二、NPX值的计算流程

    1、原始信号采集

    (1)qPCR方式记录循环阈值(Cq),NGS方式记录序列标签数;

    (2)去除空白孔、内参基因异常值,确保基础数据质量。

     

    2、标准化与对数转换

    (1)使用Olink内部控制(内参蛋白、扩增对照)进行批次效应校正;

    (2)归一化后进行log2转换,输出稳定的NPX值,常见范围约在 -5 至 15 之间。

     

    3、质量控制步骤

    (1)检测LOD(检测下限)以下的信号会标记为缺失或低可信度;

    (2)利用标准品或重复样本检查跨批次一致性,CV通常控制在10%以内。

     

    三、如何正确解读NPX数据

    1、相对变化分析

    (1)重点关注组间NPX差异,而非绝对值大小;

    (2)常用统计方法包括t检验、ANOVA或非参数检验,结合FDR校正筛选差异蛋白。

     

    2、生物学意义解读

    (1)建议结合Fold Change(2的指数差)与p值共同筛选候选蛋白;

    (2)可结合通路富集(KEGG/Reactome)和多组学数据(转录组、代谢组)进行功能分析。

     

    3、注意事项

    (1)不同项目间的NPX不能直接横向比较,因为其归一化方式与批次效应不同;

    (2)对临界表达或低丰度蛋白需关注LOD标记,避免过度解读。

     

    四、百泰派克生物科技的支持

    1、数据处理与分析服务

    (1) 提供NPX标准化处理、差异分析、通路注释和可视化报告;

    (2) 协助科研人员根据NPX结果筛选可靠的候选生物标志物。

     

    2、整合验证方案

    (1)为关键蛋白提供ELISA或质谱验证,转化NPX为绝对浓度;

    (2)输出符合论文发表和临床研究规范的完整数据包。

     

    NPX是Olink蛋白组学结果解读的核心指标,代表经过标准化的相对蛋白丰度。科学理解NPX的统计学和生物学意义,有助于科研人员更准确地识别候选标志物并进行后续研究。百泰派克生物科技凭借丰富的项目经验和双平台验证能力,帮助研究团队从NPX数据解读到成果转化,打通蛋白组学研究全流程。

     

    百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

    相关服务:

    Olink蛋白质组学

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