Olink PEA vs. 质谱:两种蛋白组学方法对比分析
在蛋白组学研究中,质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink基于PEA(Proximity Extension Assay)技术是两类主流方法。两者各自具备独特优势,适合不同的研究场景与目标。本文将从技术原理、检测通量、灵敏度、定量能力及应用场景等方面对两者进行系统对比,帮助科研人员合理选择最合适的技术路线。
一、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink的核心原理
1、Olink PEA 技术
(1)基于双抗体探针结合目标蛋白,近距离寡核苷酸通过DNA聚合生成扩增模板;
(2)采用qPCR或NGS作为读出,检测灵敏度可达fg/mL;
(3)以预定义面板(最多约3000+蛋白)实现高通量分析。
2、质谱蛋白组学
(1) 样本经蛋白酶消化为肽段,利用LC-MS/MS进行分离与鉴定;
(2)无需抗体,理论上可检测上万种蛋白;
(3) 可通过DDA(Data Dependent Acquisition)、DIA(Data Independent Acquisition)或PRM(Parallel Reaction Monitoring)等模式进行定性或定量。
二、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink检测通量与覆盖范围对比
1、Olink PEA
(1)单次可检测数百至3000+目标蛋白;
(2)覆盖常见疾病相关通路(炎症、肿瘤、代谢等);
(3)受限于抗体面板,无法捕获面板外的新蛋白。
2、质谱
(1)理论覆盖度更高,尤其适合无偏全谱探索;
(2) 对低丰度、难检蛋白需优化前处理或富集;
(3) 高通量(数百样本)分析需较长仪器运行时间。
三、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink灵敏度与定量能力
1、灵敏度
(1)Olink可检测fg/mL水平蛋白,低丰度信号检测优于多数常规质谱;
(2)质谱对高丰度蛋白覆盖广,但低丰度蛋白需前处理富集或高灵敏度平台。
2、定量能力
(1)Olink输出相对定量(NPX值),需标准品换算绝对浓度;
(2) 质谱可通过内标法实现绝对定量,尤其适合药代动力学或定量验证。
四、质谱(Mass Spectrometry, MS)与Olink适用研究场景
1、适合Olink的场景
(1)大规模临床队列研究(上千样本),高效检测预定义蛋白组;
(2)需要低样本量(1-3 μL)和高重复性的研究;
(3)快速筛选候选生物标志物。
2、适合质谱的场景
(1) 发现性研究:全谱探索、鉴定新蛋白、未知修饰;
(2) 需要绝对定量或深度覆盖(尤其在机制研究)时;
(3) 开发个性化定制的靶向检测方法(PRM、MRM)。
五、百泰派克生物科技的综合解决方案
1、双平台集成
(1)为探索性研究提供质谱无偏鉴定;
(2)结合Olink高通量验证,实现标志物从发现到验证的完整流程。
2、生物信息学支持
(1)提供标准化数据处理(NPX计算、质谱峰提取);
(2)多组学整合(转录组、代谢组),帮助科研人员快速获取可发表成果。
Olink PEA与质谱是蛋白组学中互补的两大技术。前者适合大规模、低样本量、高灵敏度的高通量研究,后者则在全谱探索、绝对定量及靶向验证方面具备优势。百泰派克生物科技结合两者优势,为科研团队提供从探索到验证的全流程服务,加速标志物研究及临床转化。
百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商
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