多肽打质谱总是多两个氢

当我们对多肽进行质谱分析时，经常会发现其质谱数据与预期存在两个质量单位的差异，这是为什么呢？

实际上，这是由于多肽打质谱的过程中，加入了两个氢离子的结果。这个过程可以简单地描述为多肽在质谱源中被电离，形成带电的离子，然后被加速并在质量分析器中被检测。在这个过程中，多肽中的基团（如羟基、羧基等）可能会吸附氢离子而形成带电离子。具体来说，这通常涉及多肽的羧基末端和氨基末端的质子化过程。

当两个氢原子被添加到多肽时，多肽的质量将增加两个质量单位。这就解释了为什么我们在质谱数据中经常看到两个质量单位的差异。然而，当我们解释质谱数据时，我们一般不会将这两个质量单位的差异归因于结构上的改变，而是将其看作是质谱分析过程中的一个结果。