磷酸化位点在质谱图中怎么看

在质谱图中，磷酸化位点的识别主要依赖于磷酸化肽段的精确质量和特征分裂图谱；主要有五个步骤：查找精确质量、查找特征分裂峰、利用软件辅助识别、手动验证磷酸化位点。

 

一、查找精确质量

磷酸化导致肽段质量增加了80.0 Da。因此，首先要查找质量增加了80.0 Da的肽段；这通常可以通过对未磷酸化和磷酸化肽段进行质谱图比较来实现。

 

二、查找特征分裂峰

磷酸化肽段的MS2光谱中通常具有一些特征分裂峰；最常见的是98 Da的峰，这是由于磷酸基团在碰撞诱导解离(CID)过程中与H3PO4形成中性丢失；此外，还可能出现49 Da和83 Da的峰，这些也是磷酸基团丢失的标志。

 

三、利用软件辅助识别

有一些质谱软件（如 Mascot，SEQUEST 等）可以自动识别磷酸化位点，这些软件通常使用概率模型来评估磷酸化位点的置信度。

 

四、手动验证磷酸化位点

即使使用软件辅助，也需要手动验证磷酸化位点，主要是检查MS2谱图，确认是否存在磷酸化特征峰，以及磷酸化位点周围的b离子和y离子序列。

 

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