蛋白翻译后修饰组学中的平行反应监测（PRM）方法
蛋白翻译后修饰（PTM）组学是研究蛋白翻译后修饰的整体状态和动态变化的学科。它涉及多种PTM类型，如磷酸化、乙酰化、SUMO化、泛素化、甲基化等。为了高效且准确地检测和定量蛋白质的PTM状态，质谱技术，特别是靶向质谱方法如平行反应监测（PRM）已经被广泛应用。
平行反应监测（PRM）是一种靶向质谱策略，适用于高选择性、高灵敏度和高准确度的PTM定量。以下是关于蛋白翻译后修饰组学中PRM的一些核心要点：
1.工作原理：
PRM策略使用高分辨率和高质量精度的仪器在特定的母体/子离子对进行监测。这意味着在质谱实验中只会检测预先选择的特定PTM位点或肽段。
2.样品准备：
样品通常经过酶解，之后根据特定的PTM进行富集，例如使用金属亲和色谱富集磷酸化肽段。
3.靶向性：
PRM是靶向策略，需要预先知道要监测的目标PTM肽段的信息。
4.定量能力：
通过测量预先选择的肽段的特定断裂离子，PRM提供了高度准确的定量信息，常与内标肽共同使用来提高定量准确性。
5.应用：
PRM适用于验证非靶向质谱实验中发现的PTM，或在生物样品中进行精确定量。
6.与SRM/MRM比较：
PRM与选择性反应监测（SRM）或多重反应监测（MRM）相似，但PRM利用高分辨率仪器检测所有可能的断裂离子，从而提供了更多的信息。
PRM为蛋白质PTM组学研究提供了一个强大的工具，特别是当需要高度的定量准确性和重复性时。它已经被广泛应用于各种生物样品和疾病模型中，以揭示PTM的功能和调控机制。
图1
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