MALDI-TOF质谱数据分析

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）的离子源通过激光轰击待测样品与基质形成的共结晶薄膜，使基质从中吸收能量并传递给生物分子，二者间发生质子（即电荷）转移而使生物分子电离。电离的生物分子在电场作用下加速通过飞行管道，根据到达检测器的时间及离子的数量得到质荷比值（m/z）及信号值而形成相应的峰图。进行MALDI-TOF-MS分析过程中可优化脉冲激光、模式、加速电压、激光强度等参数，最终获得理想的质谱图。

MALDI-TOF质谱数据分析过程中，需要对得到的谱图进行肽质量指纹谱（PMF）数据库搜索，将数据库中的蛋白序列理论酶切成肽段，计算其理论图谱，与实验图谱进行比对得到结果（扣除基质本底、酶自切和角蛋白污染峰）。

此外，需要根据样品的具体结果进行相应的分析。若一个点鉴定得到多个蛋白的选择，一般选择得分最高的蛋白，如果得分最高的蛋白功能不明确，同时得分稍低一些的蛋白与最高分蛋白差别不大且功能相对明确，也可以选择得分稍低一些的蛋白。串联质谱通常以肽合成结果为主，碎片离子可信度高，再结合蛋白合成分析，看碎片离子峰匹配状况，匹配越好越可信。鉴定到的蛋白还可以结合其它信息（如等电点pI，分子量MW等）进行验证。有时鉴定到的结果差别较大，很多翻译后修饰、蛋白提取及电泳过程中的人为修饰以及蛋白降解、可变剪切等会造成此现象，与质谱鉴定结果的好坏无关。

百泰派克生物科技采用高通量质谱平台提供MALDI-TOF-MS质谱鉴定分析服务，适用于对分子量低于25kDa的蛋白质进行鉴定。您只需要将您的需求和样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括样品前处理、MALDI-TOF-MS质谱分析、质谱原始数据分析和生物信息学分析。