ATAC-seq测序原理(染色质可及性)
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种用于研究染色质开放区域(即易于转录因子和其他蛋白质结合的DNA区域)的技术。ATAC-seq利用一个被称为Tn5转座酶的蛋白质将测序接头插入到活跃的染色质区域,转座酶的作用导致DNA断裂,产生长度不等的DNA片段。这些片段反映了染色质的开放状态,因为紧密包裹的DNA区域对转座酶不可及。插入测序接头的DNA片段随后通过PCR方法扩增,然后进行高通量测序。测序得到的数据经过分析,可以揭示哪些染色质区域在特定条件下是开放的。ATAC-seq的优势在于它能够快速、灵敏地检测整个基因组范围内的染色质开放状态,对于理解基因表达调控和细胞类型特异性的表观遗传学特征非常有用。
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