双向差异凝胶电泳

    双向差异凝胶电泳(Two-Dimensional Differential Gel Electrophoresis, 2D-DIGE)是一项广泛应用于蛋白质组学研究的技术,旨在高效、准确地比较不同样本中蛋白质的差异。这项技术通过结合两种电泳分离原理——等电聚焦(IEF)和常规SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳)使得科学家能够在同一凝胶中同时分析多个样本中的蛋白质,从而实现高分辨率的蛋白质分离与定量分析。2D-DIGE技术特别适用于研究不同生物条件下蛋白质的表达变化,广泛应用于癌症研究、疾病机制探索、药物筛选、环境监测等领域。2D-DIGE的核心优势在于其差异化的样本标记和高灵敏度检测。与传统的2D凝胶电泳技术相比,双向差异凝胶电泳技术通过使用荧光标记剂对不同的蛋白质样本进行标记从而避免了样本间的杂交干扰。常见的荧光染料如Cy3和Cy5分别标记不同的样本,通过激光扫描仪检测标记荧光的强度,进而分析蛋白质的表达水平变化。由于这种标记方法能够同时在同一凝胶上检测多个样本,因此大大提高了实验的重复性和准确性。尤其是在处理来自不同实验组或临床样本时,双向差异凝胶电泳能够确保实验结果的可靠性与可比性,是进行蛋白质定量分析的理想选择。

     

    在双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)中,样本首先通过等电聚焦进行分离,等电聚焦是一种基于蛋白质在不同pH条件下的等电点差异进行分离的方法。每个蛋白质在pH梯度中会移动到其等电点并在此停止迁移,形成具有不同pI(等电点)值的条带。接下来蛋白质样本会通过SDS-PAGE进行第二次分离。在这个过程中,蛋白质会根据其分子量进行迁移和分离。通过这两次电泳过程,2D-DIGE能够在二维空间内对蛋白质进行高效的分离与标记,使得蛋白质的复杂性得以充分展现。

     

    双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)技术的应用范围非常广泛,特别是在生物医学研究中,它为揭示疾病相关的蛋白质变化提供了强有力的工具。通过对不同状态下(如健康与病变、治疗前与治疗后)样本的比较,研究人员能够识别出在疾病发生、发展过程中起关键作用的蛋白质。例如在癌症研究中,2D-DIGE可以帮助科学家识别与肿瘤发展、转移及耐药性相关的特异性蛋白质,进而为癌症的早期诊断和靶向治疗提供潜在的生物标志物。在心血管疾病、糖尿病、神经退行性疾病等方面的研究中,2D-DIGE同样能提供关于病理变化的蛋白质信息。除了疾病研究,2D-DIGE还在其他领域得到了广泛应用;在植物科学中,2D-DIGE能够帮助研究人员探索植物在不同环境压力下的蛋白质响应,例如干旱、盐胁迫或病虫害等。在农业和食品科学领域,2D-DIGE被用于研究食品加工过程中的蛋白质变化,帮助提升食品的质量与营养价值。此外,2D-DIGE还可用于药物筛选和毒理学研究,通过监测药物处理前后蛋白质表达的变化,筛选出潜在的药物靶点或毒性标志物。

     

    双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)技术不仅能够高效分离蛋白质,还能够实现蛋白质的定量分析。通过对不同样本的荧光标记强度进行比对,研究者可以量化不同条件下蛋白质的相对表达量,从而揭示生物学过程中蛋白质表达的动态变化。与传统的蛋白质组学技术相比,2D-DIGE不仅提高了样本处理的通量也增强了对低丰度蛋白的检测能力。此外2D-DIGE还能有效避免传统凝胶电泳中的染色差异和实验偏差,确保实验结果的高可重复性。

     

    不过双向差异凝胶电泳(2D-DIGE)也有其局限性,由于技术本身依赖于SDS-PAGE进行分离,因此在处理非常大的蛋白质或具有较复杂二级结构的蛋白时可能无法获得完全分辨。此外,2D-DIGE对于一些低丰度的蛋白质仍然存在检测灵敏度的限制,因此结合其他蛋白质组学技术(如液相色谱-质谱联用技术,LC-MS/MS)往往能获得更加全面和精准的分析结果。

     

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