一站式免疫肽组服务解决方案
- 识别个体化新抗原，用于癌症疫苗开发或TCR-T细胞治疗
- 构建疾病相关抗原谱，用于自身免疫或传染病研究
- 揭示抗原加工与MHC限制性表达规律，加深对免疫识别本质的理解
在癌症免疫治疗、个体化疫苗开发、自身免疫疾病机制解析等前沿研究中，免疫肽组学（Immunopeptidomics）正在成为连接基础免疫研究与临床转化的关键技术。通过高分辨率质谱技术解析主要组织相容性复合体（MHC）呈递的抗原肽段，免疫肽组学帮助研究者揭示细胞内抗原加工与免疫识别的分子机制。免疫肽组专注于MHC分子负载的内源性/外源性短肽，其丰度极低、结构不规则，且受MHC等位基因多样性影响显著。这对实验设计、样本处理、质谱灵敏度与数据分析提出了更高要求。
一、什么是免疫肽？
免疫肽是由MHC分子呈递于细胞表面、供T细胞识别的肽段。根据MHC类别不同，呈递路径略有差异：
MHC I类：主要呈递细胞内源性抗原（如肿瘤抗原、病毒蛋白）至CD8+ T细胞，典型肽段长度为8–11个氨基酸。
MHC II类：呈递外源性抗原至CD4+ T细胞，肽段较长，可达13–25个氨基酸。
通过全面捕获这些抗原肽并进行高分辨质谱鉴定，研究者可以：
二、一站式免疫肽组服务流程解析
1、样本处理与MHC免疫富集
免疫肽组学研究的首要难点在于目标肽段丰度极低，因此，高效、特异的MHC富集是成功的前提。
（1）使用抗HLA抗体对细胞裂解液进行免疫共沉淀（IP），高效富集MHC分子；
（2）提供支持HLA-A、HLA-B、HLA-C及HLA-DR等不同亚型的抗体组合；
（3）可兼容组织样本、细胞系、PBMC、体液等多种样本类型。
2、抗原肽洗脱与纯化
通过酸洗脱或弱碱条件释放MHC负载肽段，随后经C18固相萃取（SPE）去除杂质和背景蛋白，确保进入质谱的样品具有高纯度和高回收率。
3、高分辨LC-MS/MS分析
（1）采用Orbitrap Exploris 480等高灵敏质谱平台，结合FAIMS Pro等前沿离子迁移技术，有效提升低丰度肽段的检测率；
（2）支持DDA（Data Dependent Acquisition）与DIA（Data Independent Acquisition）模式，适配多种研究目的；
（3）质谱扫描参数优化用于短肽段，提高片段离子质量精度与同位素分辨率。
4、生信分析与抗原注释
免疫肽组数据的价值在于生信解读。从基础注释到高级预测的全流程分析：
（1）肽段与参考蛋白组匹配，反推来源蛋白；
（2）使用NetMHCpan、IEDB、DeepHLApan等工具预测肽段-MHC亲和力；
（3）提供新抗原筛选、突变肽识别、抗原优先级打分；
（4）GO、KEGG通路富集，结合疾病数据库进行功能注释。
三、技术挑战：为什么免疫肽组分析不易？
免疫肽组检测的核心在于从复杂背景中富集并鉴定低丰度肽段，这对技术平台和数据解析能力提出了极高要求：
1、无酶切肽段：天然肽段并非源自胰蛋白酶切，质谱解析难度高；
2、肽段极短或变异：MHC限制的肽段常见突变、修饰，需高分辨率检测；
3、样本背景复杂：尤其是组织样本中非特异性蛋白干扰显著；
4、MHC亚型多样性：不同个体MHC分型复杂，影响肽段呈递谱系；
因此，标准化的富集流程、高灵敏的质谱平台、以及精准的数据解码算法是免疫肽组成功与否的关键。
免疫肽组学作为连接抗原识别与免疫应答机制的关键技术平台，正不断推动精准免疫研究向纵深发展。在此过程中，实验设计的精确性、数据采集的灵敏度、以及分析的深度都决定了研究成果的质量。作为深耕蛋白组学和质谱技术多年的科研服务企业，百泰派克生物科技致力于以技术创新赋能科研探索。我们不仅提供一站式高质量免疫肽组解决方案，更以严谨、专业、协作的态度，陪伴每一位科研工作者走得更远。欢迎联系我们获取技术资料或定制服务方案，让数据更有价值，让发现更具深度。
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