高通量免疫多肽组学分析平台助力药物靶点筛选

在现代药物研发过程中，靶点发现始终是核心挑战之一。尤其是在肿瘤、感染性疾病和自身免疫疾病等复杂病理环境中，精准识别并验证可成药靶点，是决定药物开发成败的关键因素。近年来，免疫多肽组学（Immunopeptidomics）作为质谱驱动的前沿技术，正在成为药物靶点筛选与验证的重要工具。

一、什么是免疫多肽组学？

免疫多肽组学是一种专注于分析主要组织相容性复合体（MHC）呈递肽段的组学方法，能够系统性地解析细胞表面通过MHC分子呈递给T细胞的多肽抗原。这些多肽是细胞代谢与病理状态的直接反映，因此被认为是极具潜力的免疫治疗靶点来源。

与传统蛋白质组学不同，免疫多肽组学聚焦于以下几个关键特征：

• 来源肽段短（8–15氨基酸）；

• 无需酶切，天然存在于样本中；

• 定量差异直接反映免疫识别变化；

• 可用于预测与验证CD8⁺/CD4⁺ T细胞表位。

二、技术原理：从抗原提取到质谱解析

1、HLA肽复合物富集

免疫多肽组学分析的第一步是通过特异性抗体对HLA-I 或 HLA-II 分子进行免疫沉淀（IP），进而富集其天然结合的肽段。这一步骤对抗体质量、样本类型和富集条件极其敏感，是实验成败的关键。

2、高分辨质谱分析

富集到的肽段随后通过高灵敏度质谱平台（如 Orbitrap Exploris、Fusion Lumos）进行非酶切直读分析。由于这些肽段多为低丰度、短序列，因此对仪器灵敏度、质量精度和数据解析算法要求极高。

3、数据解析与抗原表位预测

使用免疫多肽专用数据库（如IEDB、NetMHCpan）对检测到的肽段进行结合亲和力预测、T细胞免疫原性评估，并可结合RNA-seq或全外显子组测序（WES）数据，进一步挖掘新生抗原（Neoantigen），用于精准靶点筛选。

三、应用场景：免疫多肽组学在药物靶点筛选中的核心价值

1、新生抗原靶点识别

在肿瘤免疫治疗领域，Neoantigen 是极具特异性和安全性的免疫靶点。通过免疫多肽组学，可直接验证肿瘤细胞是否在HLA分子上实际呈递突变肽段，大幅提高靶点筛选的可信度。

2、自身免疫病机制研究

通过对患者组织或血液样本中HLA呈递肽段的系统性分析，可揭示疾病相关自体抗原，从而为自身免疫疾病靶向治疗提供依据。

3、病毒感染抗原靶点挖掘

在新发病毒感染（如SARS-CoV-2）研究中，免疫多肽组学可用于识别病毒蛋白在感染细胞中的真实呈递肽段，加快疫苗与抗病毒药物设计。

4、生物制剂脱靶风险评估

对于ADC、CAR-T等治疗模式，免疫多肽组学可用于评估潜在脱靶表位，从而提前优化分子设计，降低免疫相关副作用。

四、百泰派克生物科技：构建高通量免疫多肽组学分析平台

在百泰派克生物科技，我们基于多年蛋白组学与质谱技术积累，构建了一套高灵敏、高通量、可定制的免疫多肽组学分析平台，专为药物靶点发现与验证场景优化。

平台核心优势：

• 高效HLA肽富集方案：自研优化抗体与富集流程，适配多种组织类型。

• 全流程质控体系：从样本处理到数据解析，标准化控制实验重现性。

• 定制化分析服务：支持Neoantigen预测、TCR表位筛选、脱靶评估等多维需求。

• 结合转录/突变组数据联合分析：提升靶点发现生物学解释力。

随着质谱技术的不断进步及生物信息学算法的持续优化，免疫多肽组学将成为未来精准医学时代不可或缺的工具之一。它不仅为靶点筛选提供了更“生理相关性”的证据，还为免疫治疗的个性化设计提供了数据支持。未来，我们期待通过与更多科研机构、制药企业的合作，将百泰派克生物科技的免疫多肽组学平台，应用于更多疾病模型与药物开发路径中，共同推进创新疗法的临床转化。如您正在进行药物靶点筛选、Neoantigen预测或抗原表位验证项目，欢迎联系我们获取一对一定制化服务方案。

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