个性化癌症免疫疗法中的HLA肽组分析策略

随着免疫治疗在癌症治疗中的广泛应用，个性化肿瘤疫苗、TCR-T和CAR-T等策略成为研究热点。然而，疗效的差异性和个体化应答的复杂性也逐渐暴露出精准免疫策略的短板。在此背景下，HLA肽组（Immunopeptidome）分析应运而生，它作为链接抗原加工与T细胞识别的关键一环，正在成为肿瘤免疫治疗中不可或缺的精准靶点发现工具。

一、HLA肽组：肿瘤免疫监视的“信息快递员”

1、什么是HLA肽组？

HLA肽组，亦称免疫肽组，是指通过MHC I类或II类分子呈递在细胞表面的短肽集合。这些肽段源自细胞内的蛋白降解产物，涵盖了包括癌基因突变产物（neoantigens）在内的多种抗原。通过HLA肽组的分析，我们可以真实捕捉肿瘤细胞向免疫系统传递的抗原信号。

2、与转录组和蛋白组数据的区别

虽然转录组和蛋白组数据可揭示潜在抗原的表达情况，但并不能预测其是否被加工并呈递。相比之下，HLA肽组分析直接识别已被MHC加载、具有实际免疫原性潜力的肽段，是真正连接抗原源与T细胞识别之间的桥梁。

二、HLA肽组分析的核心技术路径

1、免疫沉淀富集MHC复合物

该步骤通过特异性抗体（如W6/32）富集细胞表面的MHC分子。样本类型可涵盖细胞系、组织切片、甚至临床肿瘤组织。此步骤对实验条件要求极高，需确保MHC复合物结构稳定，避免肽段脱落。

2、酸洗洗脱肽段并纯化

从MHC分子中洗脱出的短肽（通常为8–12 mer）需通过固相萃取等手段进行纯化，以去除杂质和干扰物质。这一步是获得高质量质谱数据的关键前处理环节。

3、LC-MS/MS高分辨质谱分析

采用如Orbitrap Exploris、Q Exactive等高分辨率质谱平台，配合数据依赖采集（DDA）或数据独立采集（DIA）策略，获取HLA肽谱信息。HLA肽段的非酶切特性和低丰度特点对仪器灵敏度和分辨率提出挑战。

4、专属数据库搜索与肽段鉴定

常规蛋白数据库搜索策略（如SEQUEST、Mascot）难以胜任HLA肽段鉴定任务，需借助特异性算法如NetMHCpan、MS-GF+、PEAKS DB + de novo等进行识别与结合亲和力预测。

三、个性化癌症免疫治疗中的应用场景

1、新抗原筛选与个体化疫苗开发

HLA肽组分析可验证突变位点是否真正呈递于MHC表面，从而筛选出免疫原性强、表达可靠的新抗原。这为个体化肿瘤疫苗设计提供实证支持，提升治疗靶点的精准度。

2、肿瘤免疫逃逸机制解析

部分肿瘤通过MHC表达下调或抗原加工通路改变来逃避免疫监视。HLA肽组分析可揭示其表位缺失机制，助力免疫耐受/逃逸研究。

3、助力TCR-T/TIL疗法靶点验证

在TCR-T或TIL治疗开发过程中，HLA肽组数据可辅助确认目标肽段是否实际呈递，减少脱靶风险，提升TCR亲和力选择的合理性。

四、百泰派克生物科技的HLA肽组分析解决方案

在百泰派克生物科技，我们融合高灵敏质谱平台 + 专业级样本富集流程 + 定制化生信算法管线，构建了一体化的HLA肽组分析服务体系，覆盖从样本准备到肽段筛选、免疫原性预测、靶点验证等多个关键环节。

技术亮点包括：

• 支持临床低量样本（>10^7细胞），适用于肿瘤活检组织、FFPE样本等

• 支持HLA I/II类呈递肽段双通路分析

• 结合NetMHCpan与de novo算法，提升新抗原识别率

• 搭载高分辨Orbitrap平台，保证数据质量与覆盖度

• 可结合蛋白组/转录组数据进行多组学联合解读

我们致力于为科研用户与生物医药企业提供真正可转化、可验证、可追踪的免疫靶点发现解决方案。

HLA肽组分析作为连接癌细胞抗原展示与T细胞识别的关键桥梁，正逐步成为个性化癌症免疫疗法的重要基石。随着质谱技术与算法手段的不断进化，其在精准靶点发现、免疫监测与耐药机制研究中的应用潜力将持续扩大。百泰派克生物科技，深耕蛋白质组与免疫组学前沿，助力科研创新与转化落地。如您正在开发肿瘤疫苗或免疫细胞治疗产品，欢迎联系我们，获取专业的一对一HLA肽组分析建议与服务。

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