磷酸化质谱结果怎么看

磷酸化是一种非常重要的翻译后修饰，在多种生命活动的调控包括生物的生长发育、信号转导以及疾病进程等过程中发挥不可或缺的功能。当下蛋白质组学研究正如火如荼地发展，随着技术的不断成熟，依赖于质谱的蛋白质磷酸化的检测，极大地推动了磷酸化蛋白质组学的发展。

但是我们知道磷酸化蛋白质组学中鉴定到的磷酸化位点未必都是真实的，仍然存在一些假阳性。磷酸化质谱结果怎么看才能识别并鉴定出可靠的磷酸化位点？

在通过肽段鉴定对蛋白质组学进行分析时，可通过评估假发现率（false discovery rate，FDR）来评价肽段序列匹配结果的正确率，一般通过FDR＜1%来筛选可信度更高的蛋白质组学数据。

但对于修饰位点的鉴定，仅依靠FDR一个指标是不足以对其进行分析的，因此在梳理PTM质谱数据时还需结合修饰位点进行错误定位率（false localization rate, FLR）指标进行评估分析，通常认为FLR＞0.75的修饰位点是可信的。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，推出磷酸化定量蛋白组分析服务技术包裹。只需要将您的实验目的告诉我们并寄送样品，百泰派克生物科技负责项目后续，包括蛋白提取、蛋白酶切、磷酸化肽段富集、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析所有事宜。