转录组与蛋白组联合分析九象限图

    转录组与蛋白组分别从RNA和蛋白质水平对样本进行研究,转录组主要是基因的表达情况,蛋白组主要是转录组的翻译情况,将两者进行整合分析即转录组与蛋白组联合分析,可以对两者的数据进行差异分析,从众多候选基因中快速寻找与研究性状相关的关键基因。

    由于翻译调控机制的存在,实际上蛋白组与转录组的数据相关性较低,九象限图此时就可以发挥关键作用。九象限图是在原有的四象限图的基础上发展升级而来的,可以更直观、更精细的展示基因与蛋白的相关变化情况。九象限图的横坐标是转录组差异倍数log2值,纵坐标是蛋白组差异倍数log2值,图中的每个小圆点代表一个基因或蛋白质,分别通过两条与横坐标和纵坐标平行的虚线将图划分为九个区域,每个区域代表不同的涵义。与横坐标平行的虚线表示转录组的差异倍数阈值,与纵坐标平行的虚线表示蛋白组的差异倍数阈值,阈值线外代表差异显著的基因或蛋白质,反之,阈值线内则表示差异不显著的基因或蛋白。

    百泰派克生物科技基于Illumina高通量测序平台的转录组测序服务,能够在单核苷酸水平上检测任何物种的整体转录水平,与可提供多种蛋白质组学的定量和定性服务的Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱,结合可定制化的生物信息学分析方法进行整合,百泰派克为您提供从实验设计、样品检测、数据分析一站式转录组学和蛋白质组学整合分析服务,可满足多种检测需求。

    相关服务:
    转录组学和蛋白质组学整合分析
    多组学整合分析
    脂质组学与蛋白质组学整合分析
    转录组学与代谢组学整合分析
    转录组学与脂质组学整合分析
    代谢组与16S rDNA测序整合分析
    蛋白质组学与代谢组学整合分析
    翻译后修饰蛋白质组与代谢组整合分析


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