代谢组自下而上分析
“自下而上”是一种蛋白质质谱分析策略,“自下而上”策略中质谱仪不直接检测大分子蛋白质,而是检测蛋白质酶解消化得到的小分子肽段,再通过肽段的信息推导整个蛋白质的相关信息。简而言之,就是通过小分子肽段研究完整蛋白质,是一种从部分到整体的分析方法。
代谢组是生物体生命活动过程中产生的所有小分子内源代谢物的集合,包括一些生物大分子的前体和降解产物,其分子质量通常在1000Da之内,如氨基酸、糖类、有机酸、脂质、维生素、核苷、核苷酸、辅因子、乳酸、乙醇和抗生素等。由于代谢物通常不会继续分解或者降解后变成性质和结构不相同另外的一种或多种物质,所以进行代谢组质谱分析时直接检测代谢物,而不适合利用“自下而上”的策略。
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