百泰派克生物科技BTP客户案例:利用蛋白质谱测序技术表征Rps4l 编码的蛋白

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    期刊:Molecular Therapy;影响因子:12.9150

    原文链接:DOI: 10.1016/j.ymthe.2021.01.005

    研究对象:肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)

    研究目的:探究lnc-Rps4l编码的肽是否参与缺氧诱导的PASMC增殖

    研究手段:蛋白质组学测序等

    研究内容及结论:缺氧引起的肺动脉平滑肌细胞(PASMCs)增殖是肺动脉高压(PH)的重要病理过程。预防PASMCs增殖可有效降低PH死亡率。长非编码RNA(lncRNA)参与增殖过程。最近的证据表明,由lncRNA编码的功能肽在细胞病理生理过程中起着重要作用。先前的研究表明,具有高编码能力的lnc-Rps4l在缺氧条件下介导PASMCs增殖。在这项研究中假设lnc-Rps4l编码的肽参与缺氧诱导的PASMC增殖。生物信息学、免疫荧光和免疫组织化学证实,在低氧条件下,pASMCs中存在lnc-Rps4l编码的40S核糖体蛋白S4 X亚型多肽(RPS4X)。用MTT法、溴脱氧尿苷(BrdU)掺入法和免疫荧光法检测RPS4XL对缺氧性PASMCs增殖的抑制作用。通过生物信息学、免疫共沉淀(CoIP)和质谱分析,鉴定出RPS6与RPS4XL相互作用。此外,LNC-Rps4l编码的多肽RPS4XL通过与RPS6结合并抑制RPS6在p-RPS6(Ser240+Ser244)位点的磷酸化来抑制RPS6过程。这些结果系统地阐明了Rps4l编码的多肽RPS4XL在PASMCs增殖中的作用和调控网络。这些发现为早期诊断提供了潜在的靶点,并为治疗缺氧PH提供了主要化合物。

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    利用蛋白质谱测序技术表征Rps4l 编码的蛋白,该服务由北京百泰派克生物科技提供。为了确认该肽段的aa序列,将ORF-FLAG质粒转染到PASMCs中,再使用抗flag抗体进行共免疫共沉淀,最后切出与肽的预测分子量相对应的凝胶条带进行质谱分析,结果检测到Rps4l编码的RPS4XL肽的几个特异性肽段。生物信息学分析预测,RPS6、EHMT2和NANOG与rps4l编码的多肽RPS4XL相互作用,然而,CoIP和质谱分析表明,只有RPS6而不是EHMT2或NANOG与RPS4XL相互作用。

     

    参考文献:Li Y, Zhang J, Sun H, et al. lnc-Rps4l-encoded peptide RPS4XL regulates RPS6 phosphorylation and inhibits the proliferation of PASMCs caused by hypoxia[J]. Molecular Therapy, 2021, 29(4): 1411-1424.

     

    百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家

    北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务,业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台,服务3000+企业,10000+客户的选择,致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

    相关服务:

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