ABPP如何支持高通量化合物筛选？
在药物发现的早期阶段，研究者往往需要在数百甚至上千个候选化合物中筛选出具备良好活性、特异性和安全性的分子。然而，传统筛选方法如酶活性抑制实验、结合亲和分析等，虽然高通量，但缺乏靶点层面的直接功能读数，无法提供分子在细胞或体内“真实起作用”的证据。
活性位点探针蛋白质谱（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）正在成为药物筛选的重要辅助工具。其优势在于不仅能在复杂生物系统中验证靶点结合的功能效果，还能在全蛋白组尺度评估潜在脱靶风险，为高通量化合物筛选带来前所未有的分辨率和可靠性。
一、什么是ABPP？为什么它适合用于高通量化合物筛选？
ABPP 是一种利用共价活性探针特异性标记蛋白质活性位点，并通过高分辨率质谱进行检测的技术。相比于蛋白组学，ABPP聚焦于“功能蛋白”——即那些在特定生物状态中真正处于活跃状态、发挥生物学效应的酶类蛋白。
对于药物筛选而言，ABPP可实现：
1、功能性靶点验证：判断小分子是否真正影响目标酶的活性；
2、脱靶谱监测：分析分子是否误伤其他酶类蛋白；
3、基于功能蛋白组的筛选维度：避免仅靠表达量或结构亲和力做判断。
二、ABPP在高通量化合物筛选中的核心应用场景
1、靶点抑制效果评估：竞争型ABPP（Competitive ABPP）
ABPP的一项重要策略是竞争结合实验，用于评估候选化合物是否与目标蛋白活性位点发生相互作用。
实验原理如下：
（1）样本（细胞或裂解液）先与化合物孵育；
（2）添加活性探针与酶结合；
（3）若化合物占据了活性位点，则探针结合减少；
（4）通过质谱定量被探针标记的蛋白，评估“抑制程度”。
优势： 直接验证功能性结合，不依赖表达量或假设机制。
2、脱靶效应全面评估：功能蛋白组谱监测
在药物研发中，脱靶是临床失败的重要原因之一。ABPP可一次性检测多个酶类蛋白活性，提供候选分子影响下的活性蛋白全景图谱。
（1）能同时监测几十甚至上百个靶点级酶类；
（2）发现隐藏脱靶风险；
（3）辅助化合物结构优化和选择性增强。
3、基于活性变化的候选分子筛选平台
ABPP不仅用于验证已有化合物，也可用于构建活性变化驱动的筛选体系：
（1）利用高通量LC-MS/MS检测化合物处理后活性蛋白图谱；
（2）识别出能调节特定病理相关酶活性的分子；
（3）与表型数据联动，提升筛选精度。
应用方向：适用于抗肿瘤、抗炎、神经系统疾病等方向的功能性化合物筛选。
三、ABPP筛选流程如何开展？（推荐实验设计）
四、百泰派克生物科技ABPP药物筛选平台
作为国内领先的蛋白质组学服务提供方，百泰派克生物科技已建立成熟的ABPP药物筛选平台，具备以下优势：
1、覆盖多类型酶类探针库（支持丝氨酸酶、半胱氨酸酶、HDAC等）
2、竞争型ABPP标准流程，适配高通量化合物评估
3、结合TMT/DIA定量技术，提升活性谱分辨率与数据可比性
4、提供脱靶谱图、热图、通路分析、靶点建议一站式报告
5、高通量能力支持一次性筛选几十个化合物组合
ABPP不仅能识别谁“表达”，更告诉我们谁“在工作”，为精准药物设计提供坚实依据。如果你正在寻找一套更智能、更可靠的候选分子筛选方式，欢迎联系百泰派克生物科技，我们将为你定制基于ABPP的高通量化合物筛选解决方案，用“活性组”驱动下一代药物发现。
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